More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3329 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  86.3 
 
 
419 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  86.3 
 
 
419 aa  695    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  84.35 
 
 
413 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  83.61 
 
 
441 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  85.05 
 
 
419 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  86.91 
 
 
417 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
426 aa  848    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  87.16 
 
 
417 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  87.44 
 
 
416 aa  668    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  92.02 
 
 
427 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  89.45 
 
 
416 aa  733    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  86.91 
 
 
417 aa  672    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  84.5 
 
 
417 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  87.65 
 
 
416 aa  701    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  86.3 
 
 
419 aa  695    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  86.3 
 
 
419 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  47.2 
 
 
444 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  46.59 
 
 
435 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  47.2 
 
 
444 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  47.51 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  46.14 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  46.67 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  46.96 
 
 
444 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  46.14 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  46.56 
 
 
424 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  46.1 
 
 
443 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  46.86 
 
 
433 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  45.65 
 
 
430 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.73 
 
 
449 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  47.17 
 
 
409 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  47.42 
 
 
417 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  48.16 
 
 
410 aa  371  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  43.25 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  44.26 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  43.54 
 
 
437 aa  342  5e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  43.54 
 
 
437 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.85 
 
 
435 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  40.46 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  41.83 
 
 
437 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  40.69 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  40.69 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  40.46 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  42.04 
 
 
437 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  42.04 
 
 
437 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  40.14 
 
 
436 aa  299  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.77 
 
 
437 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.49 
 
 
436 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  41.58 
 
 
437 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 
442 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  39.26 
 
 
436 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  40.7 
 
 
413 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  41.51 
 
 
433 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  40.79 
 
 
441 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.53 
 
 
439 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  39.58 
 
 
434 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  41.88 
 
 
402 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  42.06 
 
 
434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 
449 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  38.53 
 
 
438 aa  279  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.61 
 
 
409 aa  278  1e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  39.76 
 
 
434 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.53 
 
 
411 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  40.53 
 
 
411 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.53 
 
 
411 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  40.53 
 
 
411 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  40.53 
 
 
411 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  40.26 
 
 
411 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  39.64 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  40.21 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  40.26 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  40 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  37.02 
 
 
424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  40.26 
 
 
411 aa  273  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 
409 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  39.42 
 
 
445 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  38.58 
 
 
411 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  36.68 
 
 
452 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.76 
 
 
430 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  35.81 
 
 
423 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  38.57 
 
 
437 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  35.81 
 
 
423 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  35.58 
 
 
423 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  35.58 
 
 
423 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  35.58 
 
 
423 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  35.58 
 
 
423 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  35.58 
 
 
423 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  35.58 
 
 
423 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.28 
 
 
440 aa  262  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 
445 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  39.06 
 
 
448 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  40 
 
 
423 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 
423 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 
423 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  35.12 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.75 
 
 
423 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 
424 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.26 
 
 
423 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  39.31 
 
 
424 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  39.45 
 
 
423 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>