195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3262 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  70.84 
 
 		 608 aa  916    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  63.9 
 
 		 622 aa  840    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  76.68 
 
 		 607 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  75.58 
 
 		 607 aa  956    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  77.04 
 
 		 617 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  76.51 
 
 		 607 aa  937    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  76.44 
 
 		 614 aa  951    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  76.41 
 
 		 614 aa  943    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  75.73 
 
 		 614 aa  929    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  77.08 
 
 		 614 aa  951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1250    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  66.76 
 
 		 352 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  42.32 
 
 		 627 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  45.69 
 
 		 615 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  44.97 
 
 		 615 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  42.21 
 
 		 614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  44.77 
 
 		 615 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  43.01 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  44.13 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  46.15 
 
 		 616 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  45.95 
 
 		 616 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  45.95 
 
 		 616 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  42.88 
 
 		 613 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  45.74 
 
 		 616 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  44.58 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  42.6 
 
 		 617 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  43.05 
 
 		 602 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  39.42 
 
 		 617 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  45 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  44.16 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  43.16 
 
 		 618 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  40.44 
 
 		 624 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  87.78 
 
 		 227 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  38.87 
 
 		 630 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  38.85 
 
 		 625 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  41.31 
 
 		 633 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  41.72 
 
 		 605 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  37.06 
 
 		 628 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  35.91 
 
 		 628 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  38.28 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  37.76 
 
 		 605 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  38.28 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  38.1 
 
 		 609 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  38.1 
 
 		 609 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  38.46 
 
 		 609 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  38.15 
 
 		 607 aa  361  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  37.77 
 
 		 609 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  41.63 
 
 		 611 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  38.06 
 
 		 609 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  38.49 
 
 		 611 aa  359  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  38.24 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  38.17 
 
 		 629 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.81 
 
 		 609 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  40.65 
 
 		 616 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  38.31 
 
 		 616 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  38.46 
 
 		 636 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  39.33 
 
 		 621 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  39.02 
 
 		 609 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  35.99 
 
 		 635 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  35.69 
 
 		 609 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  38.56 
 
 		 635 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  38.77 
 
 		 635 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  37.79 
 
 		 610 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.13 
 
 		 1283 aa  337  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.79 
 
 		 585 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  35.44 
 
 		 604 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  32.59 
 
 		 639 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  37.81 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  36.27 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.55 
 
 		 619 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.85 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.79 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.09 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.05 
 
 		 602 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.1 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.1 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.1 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.15 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  32.6 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.46 
 
 		 629 aa  286  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  32.46 
 
 		 583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  34.78 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.1 
 
 		 595 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  35.93 
 
 		 608 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  31.3 
 
 		 637 aa  283  9e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  31.73 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  35.86 
 
 		 621 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.62 
 
 		 599 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.36 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.1 
 
 		 591 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  31.39 
 
 		 603 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  31.37 
 
 		 603 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.16 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  35.5 
 
 		 608 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  31.56 
 
 		 603 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  31.69 
 
 		 592 aa  279  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  35.05 
 
 		 599 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  30.91 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.48 
 
 		 590 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>