49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3175 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  274  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.63 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.7 
 
 		 193 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.53 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  42.4 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.75 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  39.62 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  36.03 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.73 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  31.78 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  34.69 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  32.08 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  29.91 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  33.68 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  33.68 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  26.4 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  26.89 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  35.06 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  34.69 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8090  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.958297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  24.49 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  34.57 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  26.12 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  27 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.83 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  34.52 
 
 		 143 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  33.68 
 
 		 142 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>