264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3139 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  74.68 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  74.89 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  74.46 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  74.67 
 
 		 285 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  78.5 
 
 		 231 aa  347  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  72.22 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  74.67 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  75.23 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  74.22 
 
 		 273 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  75.59 
 
 		 230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  66.8 
 
 		 286 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  55.91 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  55.6 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  56.16 
 
 		 239 aa  258  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  54.79 
 
 		 236 aa  254  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  48.91 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  49.55 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  48.67 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  47.53 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  47.79 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  47.79 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  48.44 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  44.02 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  47 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  44 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  41.35 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  41.1 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  37.27 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  36.45 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.78 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  36.05 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.98 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.5 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  35.06 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  40.94 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  33.2 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  33.81 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  35.45 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  35.45 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  39.78 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  39.78 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  35.45 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  32.08 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.85 
 
 		 228 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.21 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  32.08 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  34.33 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.18 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.18 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  31.06 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  31.76 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  29.91 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  31.9 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  32.97 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  32.97 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.38 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  32.42 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  30.88 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.86 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.84 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  31.86 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  31.86 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  31.86 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.84 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  29.83 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.37 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  31.37 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  27.04 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  25.77 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  27.07 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  29.44 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  29.02 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  27.07 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.74 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.53 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.05 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  33.73 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  30.13 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  25.91 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  32.95 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  27.47 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  28.57 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.84 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  24.78 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  27.94 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.91 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  32.77 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  35.48 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  28.33 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  31.56 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  30.18 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  28.5 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>