More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3082 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 965 aa  1953    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 981 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 869 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 873 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 		 935 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 873 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 966 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  35.75 
 
 		 966 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 937 aa  489  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 933 aa  482  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 935 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 935 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 935 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  34.21 
 
 		 936 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 930 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 930 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 930 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 853 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 853 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 853 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 		 853 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  35.14 
 
 		 853 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 907 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 838 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 907 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 841 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 897 aa  439  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 843 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 836 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 842 aa  429  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 912 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 938 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 924 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 952 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 953 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  32.42 
 
 		 839 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 966 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 904 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 904 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 944 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 985 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 904 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 957 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 948 aa  396  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 904 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 901 aa  389  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 987 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 974 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 975 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 981 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.7 
 
 		 709 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 944 aa  379  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 1088 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 817 aa  373  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 951 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  32.2 
 
 		 929 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 966 aa  363  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.81 
 
 		 969 aa  360  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 951 aa  350  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 967 aa  349  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 946 aa  346  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 940 aa  345  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 935 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  30.21 
 
 		 914 aa  341  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 947 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 875 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 		 961 aa  334  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 973 aa  331  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 910 aa  325  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 869 aa  324  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 964 aa  323  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 1020 aa  314  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 891 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 869 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 1040 aa  308  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 855 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 1007 aa  297  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1007 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1007 aa  295  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.87 
 
 		 1007 aa  295  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 896 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 895 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 852 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 876 aa  287  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1015 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 849 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.82 
 
 		 827 aa  280  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 847 aa  279  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 861 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 861 aa  277  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 861 aa  277  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 1009 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 893 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 976 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 939 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  39.3 
 
 		 855 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 914 aa  274  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 871 aa  273  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 861 aa  272  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 861 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>