40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2963 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  58.71 
 
 		 155 aa  190  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  48.7 
 
 		 170 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  51.63 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  38.89 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  42.67 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  41.83 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  38.82 
 
 		 173 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  39.61 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  39.07 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  36.48 
 
 		 215 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  39.49 
 
 		 208 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  39.49 
 
 		 208 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  37.65 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  37.82 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  38.64 
 
 		 216 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  33.96 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  37.33 
 
 		 337 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  35.37 
 
 		 200 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  37.25 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  31.58 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  29.41 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  28.76 
 
 		 178 aa  84  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  38.13 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2467  hypothetical protein  33.87 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.206216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  31.3 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  31.48 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0045  hypothetical protein  32.8 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0045  hypothetical protein  32.8 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2504  hypothetical protein  32.8 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  28.66 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  27.38 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0922  hypothetical protein  26.83 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4919  hypothetical protein  61.11 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2644  hypothetical protein  50.91 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  30.13 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0321516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>