More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2890 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  80.33 
 
 
302 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  73.42 
 
 
303 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  70 
 
 
305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  69.33 
 
 
305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  69.67 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  69.67 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  68 
 
 
303 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  68.67 
 
 
304 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  68 
 
 
303 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  67.67 
 
 
303 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  68 
 
 
303 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  68 
 
 
302 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  69.77 
 
 
305 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  70.89 
 
 
305 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  64.57 
 
 
308 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  55.59 
 
 
319 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  56.82 
 
 
319 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  55.59 
 
 
319 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  54.72 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  52.58 
 
 
313 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  52.43 
 
 
313 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  48.01 
 
 
320 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  48.69 
 
 
310 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  48.97 
 
 
320 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  47.87 
 
 
310 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  46.3 
 
 
318 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  49.66 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  49.49 
 
 
318 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  49.32 
 
 
318 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  48.81 
 
 
308 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  49.14 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  44.37 
 
 
321 aa  262  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  45.67 
 
 
308 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  43.75 
 
 
314 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  45.3 
 
 
309 aa  241  9e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  40.6 
 
 
299 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  42.39 
 
 
305 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  40.07 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  31.9 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  33.83 
 
 
335 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  33.46 
 
 
380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  31.31 
 
 
338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  32.71 
 
 
353 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  33.83 
 
 
335 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  29.62 
 
 
338 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  32.95 
 
 
335 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.25 
 
 
338 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  32.95 
 
 
335 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  32.95 
 
 
335 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  32.95 
 
 
335 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  31.23 
 
 
338 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.24 
 
 
408 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  38.51 
 
 
400 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  32.58 
 
 
321 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  32.96 
 
 
363 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  30.48 
 
 
338 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  31.65 
 
 
350 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  31.15 
 
 
392 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  36.25 
 
 
404 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  36.25 
 
 
404 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  36.25 
 
 
404 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  28.02 
 
 
385 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.05 
 
 
400 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  30.58 
 
 
335 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.25 
 
 
404 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.05 
 
 
400 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  28.84 
 
 
396 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.13 
 
 
807 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.62 
 
 
404 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  37.84 
 
 
400 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.62 
 
 
422 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.62 
 
 
423 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  27.72 
 
 
400 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  37.16 
 
 
400 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  35.62 
 
 
425 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.62 
 
 
404 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.62 
 
 
404 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  37.16 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.16 
 
 
397 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  39.55 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.21 
 
 
711 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  36.49 
 
 
397 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.21 
 
 
711 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.69 
 
 
560 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  29.41 
 
 
392 aa  96.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  29.77 
 
 
479 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  28.82 
 
 
399 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.66 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  26.44 
 
 
396 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  28.47 
 
 
399 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  28.12 
 
 
399 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  27.93 
 
 
390 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  28.12 
 
 
399 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  26.98 
 
 
389 aa  96.3  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>