161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2853 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  34.68 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 
300 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 
479 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 
299 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.14 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
320 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.45 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  23.9 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.98 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  22.83 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  20.47 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.56 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.64 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  29.35 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.54 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  22.69 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.21 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  23.57 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  22.34 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  23.57 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
355 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.78 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  22.03 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.1 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  22.91 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  23.26 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.74 
 
 
319 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
312 aa  62.4  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.12 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.12 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  22.44 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  22.26 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  23.02 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  23.02 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  24.67 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  23.14 
 
 
334 aa  58.9  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  22.15 
 
 
319 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  22.92 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.98 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.76 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.27 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
488 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  22.26 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>