85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2848 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  100 
 
 
311 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000011699  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1737  cell division protein ZipA  66.76 
 
 
341 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000116283  hitchhiker  0.00000000149042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2378  cell division protein ZipA  63.56 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  unclonable  0.00000127891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1688  cell division protein ZipA  56.5 
 
 
325 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2897  cell division protein ZipA  55.3 
 
 
344 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1515  cell division protein ZipA  50.95 
 
 
350 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000403723  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1574  cell division protein ZipA  53.45 
 
 
346 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000216303  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1507  cell division protein ZipA  53.74 
 
 
346 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000182258  decreased coverage  0.000000000692006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2655  cell division protein ZipA  53.99 
 
 
364 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000481866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2365  cell division protein ZipA  54.71 
 
 
342 aa  328  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000198089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2462  cell division protein ZipA  50.81 
 
 
352 aa  328  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1568  cell division protein ZipA  53.28 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000509277  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2680  cell division protein ZipA  54.65 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2759  cell division protein ZipA  54.65 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000277167  hitchhiker  0.0000636327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1704  cell division protein ZipA  52.86 
 
 
368 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000875421  decreased coverage  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2515  cell division protein ZipA  54.3 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1015  cell division protein ZipA  35.84 
 
 
340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3266  cell division protein ZipA  37.66 
 
 
308 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3188  cell division protein ZipA  36.47 
 
 
318 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000114957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2745  cell division protein ZipA  36.7 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000202555  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1431  cell division protein ZipA  36.7 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000115639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1320  cell division protein ZipA  36.7 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.80007e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3445  cell division protein ZipA  37.65 
 
 
332 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000760929  decreased coverage  0.0000314053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0778  cell division protein ZipA  34.71 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000881239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  44.85 
 
 
444 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000785839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2699  cell division protein ZipA  35.78 
 
 
328 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000264058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2547  cell division protein ZipA  35.78 
 
 
328 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7392099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  42.13 
 
 
532 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000720227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02273  hypothetical protein  35.78 
 
 
328 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02312  cell division protein ZipA  35.78 
 
 
328 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000911583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1249  cell division protein ZipA  35.47 
 
 
328 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000496931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1266  cell division protein ZipA  35.47 
 
 
328 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000846548  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2940  cell division protein ZipA  34.82 
 
 
317 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000042713  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2567  cell division protein ZipA  35.03 
 
 
332 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167953  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3643  cell division protein ZipA  35.03 
 
 
332 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110035  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2768  cell division protein ZipA  35.29 
 
 
328 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000420135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  42.13 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  32.56 
 
 
318 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000297505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  54.89 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  43.62 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2354  cell division protein ZipA  31.04 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2572  cell division protein ZipA  48.87 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000023932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2621  cell division protein ZipA  48.87 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000442866  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2687  cell division protein ZipA  48.87 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000108647  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2663  cell division protein ZipA  48.87 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000146198  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2793  cell division protein ZipA  48.87 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000505214  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  31.56 
 
 
323 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0067  cell division protein ZipA  47.89 
 
 
269 aa  124  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.218831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  30.39 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1523  cell division protein  37.88 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.918664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0654  cell division protein ZipA  37.88 
 
 
225 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  42.86 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  38.64 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  38.64 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  26.93 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2338  cell division protein ZipA  27.48 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385149  normal  0.0462003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  42.64 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  43.08 
 
 
296 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  42.31 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  43.08 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  43.08 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  41.54 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  36.53 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3406  cell division protein ZipA  36.31 
 
 
342 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  38.35 
 
 
338 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  32.23 
 
 
365 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0698  cell division protein ZipA  27.56 
 
 
423 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000137968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1576  cell division protein ZipA  35.1 
 
 
395 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  24.5 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  35.34 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2542  hypothetical protein  28.3 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2672  hypothetical protein  30.95 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  34.78 
 
 
222 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2585  cell division protein ZipA  27.22 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.808255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  32.59 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00742  cell division protein ZipA  28 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415123  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0162  cell division protein ZipA  29.06 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0319  cell division protein  22.53 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00406721  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0350  putative cell division protein  26.57 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0531871  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0468  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  25 
 
 
341 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2048  cell division protein ZipA  26.23 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2129  cell division protein ZipA  26.23 
 
 
243 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.281961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  27.61 
 
 
441 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1240  cell division protein-like  22.54 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4756  cell division protein FtsZ  35.9 
 
 
480 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>