More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2831 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.09 
 
 		 510 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  68.09 
 
 		 510 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.05 
 
 		 509 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.44 
 
 		 508 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.89 
 
 		 510 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.88 
 
 		 509 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.02 
 
 		 508 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.09 
 
 		 510 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1756  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  94.75 
 
 		 514 aa  966    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.814968  normal  0.67864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.63 
 
 		 508 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000358371  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.86 
 
 		 518 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.86 
 
 		 509 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  69.19 
 
 		 509 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.44 
 
 		 508 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  68.09 
 
 		 510 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  67.5 
 
 		 518 aa  646    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.86 
 
 		 509 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.02 
 
 		 509 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.09 
 
 		 510 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.76 
 
 		 528 aa  688    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.15 
 
 		 510 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.16 
 
 		 508 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0931  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.65 
 
 		 518 aa  634    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.867027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.99 
 
 		 509 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.44 
 
 		 508 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2831  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 514 aa  1031    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.5 
 
 		 518 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.25 
 
 		 510 aa  662    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.6 
 
 		 508 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.41 
 
 		 508 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.09 
 
 		 510 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.73 
 
 		 509 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.44 
 
 		 508 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.96 
 
 		 508 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.41 
 
 		 508 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.22 
 
 		 508 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.05 
 
 		 509 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000435581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.77 
 
 		 508 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2585  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.83 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.09 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000307865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.16 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1861  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.41 
 
 		 509 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60.54 
 
 		 522 aa  624  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2078  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.25 
 
 		 509 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.96 
 
 		 520 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000319763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0566  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.86 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.69 
 
 		 512 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.21 
 
 		 524 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.77 
 
 		 523 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.14 
 
 		 518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.44 
 
 		 523 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.25 
 
 		 523 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.06 
 
 		 523 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.45 
 
 		 525 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.93 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.69 
 
 		 524 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  55.79 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.6 
 
 		 532 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0547  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  57.31 
 
 		 511 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0708  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.44 
 
 		 524 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  56.12 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0091  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.11 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0101  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.11 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0110  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.11 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.196213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0726  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.87 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1814  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.73 
 
 		 518 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0260  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.92 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0120  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.16 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.301316  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1653  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.85 
 
 		 529 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.46455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2246  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  50 
 
 		 523 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07820  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  50.95 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3754  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.43 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.98 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.31 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5542  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.19 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5778  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.56 
 
 		 543 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809454  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1076  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.32 
 
 		 518 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7228  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53 
 
 		 530 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24210  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.15 
 
 		 511 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  49.81 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10581  predicted protein  45.13 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2265  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.72 
 
 		 517 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.39241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.52 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158107 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  46.39 
 
 		 1060 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  44.36 
 
 		 1128 aa  401  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0956  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00245688  hitchhiker  0.000000175975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0216  alanine dehydrogenase/PNT-like  48.05 
 
 		 379 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0700  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.05 
 
 		 379 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0667  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.05 
 
 		 379 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  47.75 
 
 		 373 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0691  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.27 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4431  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.83 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.447977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01860  NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  47.48 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0301243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4265  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.58 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2058  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.48 
 
 		 377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000804749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2684  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.77 
 
 		 379 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02450  putative NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  46.67 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0275  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.67 
 
 		 372 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.75 
 
 		 380 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3786  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.14 
 
 		 385 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>