68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2742 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  81.55 
 
 		 439 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  75.23 
 
 		 442 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  82 
 
 		 439 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  82.23 
 
 		 439 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  81.55 
 
 		 439 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  81.55 
 
 		 439 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  80.87 
 
 		 439 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  81.09 
 
 		 439 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  92.26 
 
 		 439 aa  810    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  79.73 
 
 		 440 aa  691    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 439 aa  867    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  80.87 
 
 		 439 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  83.6 
 
 		 439 aa  741    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  81.55 
 
 		 439 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  73.71 
 
 		 445 aa  624  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  64.04 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  64.4 
 
 		 441 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  63.68 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  63.35 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  63.68 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  60.45 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  62.73 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  59.6 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  56.57 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  56.14 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  56.36 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  55.68 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  55.68 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  55.68 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  56.36 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  54 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  56.36 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  56.14 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  56.14 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  56.36 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  59.64 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  53.96 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  55.91 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  59.64 
 
 		 441 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  56.59 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  56.59 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  56.59 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  57.95 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  57.05 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  58.18 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  47.65 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  47.38 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  47.38 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  48.52 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  48.05 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  45.8 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  48.6 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  47.17 
 
 		 435 aa  348  8e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  46.12 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  45.66 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  43.51 
 
 		 455 aa  332  8e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  46.35 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  43.05 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  45.23 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  41.77 
 
 		 455 aa  285  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  43.59 
 
 		 450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.03 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.91 
 
 		 521 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  25.45 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  25.16 
 
 		 507 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  26.39 
 
 		 201 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  27.34 
 
 		 569 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>