More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2738 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  90.66 
 
 		 297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  83.33 
 
 		 289 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  80.57 
 
 		 286 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  72.66 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  72.66 
 
 		 289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  73.01 
 
 		 290 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  72.32 
 
 		 290 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  72.32 
 
 		 290 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  66.44 
 
 		 289 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  65.74 
 
 		 289 aa  407  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  61.94 
 
 		 289 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  44.56 
 
 		 290 aa  292  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  46.13 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  46.07 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  42.51 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  42.05 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.93 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.6 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  78.51 
 
 		 122 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  31.97 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  30.48 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  29.62 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.74 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.62 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  31.49 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  30.03 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  29.21 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  27.43 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  30.04 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  27.49 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  28.32 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  28.46 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  26.13 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.28 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.69 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.19 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.79 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.79 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  24 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.35 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  39.45 
 
 		 890 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.57 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.05 
 
 		 607 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.62 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.64 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 417 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.86 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  48.68 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.56 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37.86 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  40.26 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  48.68 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.61 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  39 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.05 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  34.55 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.56 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.74 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.37 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.83 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  44.59 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  43.06 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 416 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>