78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2706 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2706  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0532823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1880  hypothetical protein  87.25 
 
 
204 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1559  hypothetical protein  79.51 
 
 
205 aa  344  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000960005  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2539  hypothetical protein  80.49 
 
 
205 aa  344  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1602  hypothetical protein  78.05 
 
 
205 aa  327  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00444605  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1677  hypothetical protein  77.56 
 
 
205 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260376  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1746  hypothetical protein  77.56 
 
 
205 aa  325  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2472  hypothetical protein  77.56 
 
 
205 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000127559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1872  hypothetical protein  77.07 
 
 
205 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000337406  hitchhiker  0.00000947972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2479  hypothetical protein  77.07 
 
 
205 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000487251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2592  hypothetical protein  77.07 
 
 
205 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00225749  normal  0.0485502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2234  hypothetical protein  76.59 
 
 
205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2634  hypothetical protein  76.1 
 
 
205 aa  318  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2261  hypothetical protein  76.38 
 
 
210 aa  317  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2063  hypothetical protein  72.14 
 
 
204 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000421007  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1827  hypothetical protein  68.84 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02369  hypothetical protein  49.5 
 
 
208 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0518841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003856  hypothetical protein  49.25 
 
 
205 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.489271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0645  hypothetical protein  48 
 
 
205 aa  201  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01823  hypothetical protein  48.24 
 
 
205 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2380  hypothetical protein  46.46 
 
 
219 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.386361  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2196  hypothetical protein  47.24 
 
 
205 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2901  hypothetical protein  43 
 
 
211 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0962  hypothetical protein  44.85 
 
 
209 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2153  hypothetical protein  45 
 
 
212 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0117642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1868  hypothetical protein  45.5 
 
 
212 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1719  hypothetical protein  43.65 
 
 
208 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2852  hypothetical protein  43.65 
 
 
208 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.954826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1611  hypothetical protein  43.65 
 
 
208 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2041  hypothetical protein  43.65 
 
 
213 aa  158  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1763  hypothetical protein  40.49 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.173363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1993  hypothetical protein  42.42 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.934433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2133  hypothetical protein  43.85 
 
 
213 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0109581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1312  hypothetical protein  43.85 
 
 
215 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01138  hypothetical protein  42.42 
 
 
213 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2471  hypothetical protein  42.42 
 
 
213 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1295  hypothetical protein  42.42 
 
 
213 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2515  protein of unknown function DUF489  42.42 
 
 
213 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0030119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1252  hypothetical protein  42.42 
 
 
213 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01130  hypothetical protein  42.42 
 
 
213 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1334  hypothetical protein  43.85 
 
 
213 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1350  hypothetical protein  43.85 
 
 
213 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1951  hypothetical protein  43.85 
 
 
213 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1645  hypothetical protein  43.68 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1593  hypothetical protein  43.32 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000989922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1310  hypothetical protein  43.32 
 
 
213 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2064  hypothetical protein  39.39 
 
 
209 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.890726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2021  hypothetical protein  40.93 
 
 
208 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1594  hypothetical protein  42.27 
 
 
203 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1941  hypothetical protein  40.4 
 
 
210 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1676  hypothetical protein  36.22 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1918  hypothetical protein  36.59 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3620  hypothetical protein  38.97 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1818  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.112732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4015  hypothetical protein  38.46 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3419  hypothetical protein  38.97 
 
 
208 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3266  hypothetical protein  36.95 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1267  protein of unknown function DUF489  36.55 
 
 
209 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30140  hypothetical protein  37.63 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2400  hypothetical protein  37.11 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00786814  normal  0.0777088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3359  hypothetical protein  38.14 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2580  hypothetical protein  37.77 
 
 
206 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3597  hypothetical protein  38.02 
 
 
207 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3191  hypothetical protein  38.02 
 
 
206 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.140905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01025  hypothetical protein  34 
 
 
200 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06141  hypothetical protein  34 
 
 
200 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1452  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28370  hypothetical protein  37.31 
 
 
207 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0201  hypothetical protein  34.48 
 
 
207 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0760616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1843  hypothetical protein  36.65 
 
 
227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0782  hypothetical protein  32.35 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0695  hypothetical protein  31.37 
 
 
204 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.596389  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1098  hypothetical protein  32.49 
 
 
228 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2445  hypothetical protein  32.81 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1405  hypothetical protein  32.99 
 
 
209 aa  95.1  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0923  hypothetical protein  30.46 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1042  hypothetical protein  30.46 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1949  protein of unknown function DUF489  28.36 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>