130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2691 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  100 
 
 		 169 aa  343  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  83.93 
 
 		 177 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  73.96 
 
 		 171 aa  258  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  67.66 
 
 		 172 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  66.86 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  66.86 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  67.47 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  66.86 
 
 		 175 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  67.47 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  63.31 
 
 		 175 aa  244  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  66.87 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  64.5 
 
 		 175 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  64.88 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  60.71 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  58.18 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  52.66 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  54.29 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  44.64 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  47.02 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  46.39 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  47.02 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  44.38 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  46.43 
 
 		 176 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  46.43 
 
 		 176 aa  153  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  48.77 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  51.2 
 
 		 172 aa  150  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  42.01 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  44.91 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  44.91 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  44.91 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  45.51 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  44.91 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  43.37 
 
 		 213 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  44.64 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  43.03 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  41.18 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  45.45 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  43.75 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  46.34 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  31.68 
 
 		 212 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  32.76 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  32.18 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  30.19 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  27.96 
 
 		 211 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  30.56 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  30.39 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  31.1 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  31.1 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  31.1 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  31.1 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  31.1 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  32.35 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  32.61 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  31.88 
 
 		 264 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  29.14 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  31.47 
 
 		 261 aa  63.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  32.09 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  27.94 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  31.85 
 
 		 1210 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  31.97 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  26.76 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  29.79 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  31.62 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  30.4 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  28.75 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  29.75 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  26.67 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  29.93 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  28.89 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  32.8 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  27.54 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  27.34 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>