176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2678 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2678  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  100 
 
 
199 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.401671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2425  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  92.96 
 
 
199 aa  390  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1772  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  92.82 
 
 
195 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1945  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  89.74 
 
 
195 aa  376  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00277944  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2381  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  89.74 
 
 
195 aa  376  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000554571  normal  0.329531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1624  periplasmic nitrate reductase C-type cytochrome, NapC/NirT  92.67 
 
 
195 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.123114  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1912  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  89.23 
 
 
195 aa  373  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00847918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1905  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  89.23 
 
 
195 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1938  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  89.23 
 
 
195 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00561646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2551  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family protein  87.44 
 
 
199 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1902  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  88.72 
 
 
195 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.526119  hitchhiker  8.39402e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1844  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  88.72 
 
 
195 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  hitchhiker  0.000210051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2133  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  88.72 
 
 
195 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1499  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  86.67 
 
 
195 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.924736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2983  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  80.81 
 
 
198 aa  354  4e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000569664  normal  0.0718991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4207  cytochrome c-type protein NapC  81.03 
 
 
198 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49270  cytochrome c-type protein NapC  80.51 
 
 
198 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0776862  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1055  cytochrome c-type protein NapC  80 
 
 
195 aa  339  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0086  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  85.88 
 
 
171 aa  322  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2846  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  75.13 
 
 
195 aa  317  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2440  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  74.07 
 
 
195 aa  314  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4061  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome NapC/NirT  73.54 
 
 
195 aa  313  1e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418249  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4765  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  74.6 
 
 
195 aa  312  2e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.719721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1860  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  69.46 
 
 
220 aa  304  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0369  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  70.37 
 
 
204 aa  303  1e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4723  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  74.47 
 
 
237 aa  302  2e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0585086  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0954  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  69.19 
 
 
212 aa  301  5e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5182  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  69.35 
 
 
233 aa  297  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1017  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  73.63 
 
 
204 aa  292  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4118  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  69.7 
 
 
227 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3992  hypothetical protein  68.18 
 
 
222 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0212723  normal  0.240868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2936  NapC/NirT cytochrome c domain protein  65 
 
 
234 aa  283  1e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.441265  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  61.22 
 
 
394 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0619  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  62.89 
 
 
191 aa  259  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  64.89 
 
 
199 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  64.89 
 
 
199 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  64.89 
 
 
200 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2172  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type protein NapC  60.51 
 
 
191 aa  255  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003826  cytochrome c-type protein TorY  63.64 
 
 
383 aa  251  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  59.69 
 
 
196 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.71882e-08  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  60.43 
 
 
392 aa  248  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  60.42 
 
 
200 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  60.42 
 
 
200 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  60.42 
 
 
200 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  60.42 
 
 
200 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  60.42 
 
 
200 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  60.1 
 
 
200 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05375  cytochrome c-type protein NapC  58.46 
 
 
192 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  63.89 
 
 
203 aa  243  1e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  63.64 
 
 
191 aa  242  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  63.79 
 
 
215 aa  239  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  57.3 
 
 
392 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  57.46 
 
 
392 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  57.46 
 
 
392 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  57.46 
 
 
392 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000515  cytochrome c-type protein NapC  63.91 
 
 
170 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3484  cytochrome c-type protein NapC  65.85 
 
 
205 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382018  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  57.46 
 
 
392 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  57.46 
 
 
392 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  57.46 
 
 
392 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  57.46 
 
 
392 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2364  cytochrome c-type protein NapC  55.9 
 
 
191 aa  235  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  56.91 
 
 
392 aa  235  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  56.28 
 
 
392 aa  233  1e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  56.19 
 
 
200 aa  232  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0988  tetraheme cytochrome c  56.42 
 
 
391 aa  231  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  56.19 
 
 
200 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  61.31 
 
 
233 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  56.15 
 
 
202 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  55.8 
 
 
392 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  56.35 
 
 
392 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  54.14 
 
 
392 aa  227  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.3 
 
 
234 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2730  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  51.78 
 
 
407 aa  225  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4005  NapC/NirT cytochrome c domain protein  61.25 
 
 
206 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  54.14 
 
 
392 aa  221  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  55.21 
 
 
411 aa  221  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.460429  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  54.17 
 
 
203 aa  218  4e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  62.75 
 
 
389 aa  212  3e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  58.6 
 
 
603 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  51.93 
 
 
392 aa  199  2e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  51.93 
 
 
392 aa  199  2e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  50.84 
 
 
237 aa  197  1e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  57.05 
 
 
385 aa  197  1e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  52.15 
 
 
392 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1587  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  55.7 
 
 
196 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  48.4 
 
 
389 aa  191  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  45.16 
 
 
390 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  45.16 
 
 
390 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  52.5 
 
 
195 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  45.16 
 
 
390 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  45.16 
 
 
390 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>