153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2629 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  100 
 
 
164 aa  323  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  87.2 
 
 
180 aa  293  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  52.78 
 
 
323 aa  143  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  41.43 
 
 
392 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  40.88 
 
 
178 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  41.03 
 
 
379 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  39.74 
 
 
379 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  39.74 
 
 
379 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
361 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
325 aa  117  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  45.03 
 
 
284 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39.86 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  39.86 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  42.11 
 
 
238 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  36.84 
 
 
379 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 
449 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
400 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  39.16 
 
 
199 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  37.91 
 
 
179 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  36.54 
 
 
373 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  40 
 
 
416 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  37.58 
 
 
376 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  43.86 
 
 
346 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  40.79 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  42.19 
 
 
344 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  44.64 
 
 
324 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  36 
 
 
301 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  40.6 
 
 
240 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  39.16 
 
 
199 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  37.76 
 
 
383 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  37.67 
 
 
404 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 
373 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
387 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  34.46 
 
 
231 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  40.6 
 
 
185 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  41.55 
 
 
376 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  40.52 
 
 
183 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  43.4 
 
 
378 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 
285 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  40.14 
 
 
389 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
390 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  42.24 
 
 
388 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  38.89 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  37.86 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  37.93 
 
 
368 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  40.74 
 
 
182 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  40.74 
 
 
182 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  39.16 
 
 
379 aa  97.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  36.42 
 
 
207 aa  97.1  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
410 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  38.97 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  38.97 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  39.13 
 
 
382 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 
391 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  38.97 
 
 
182 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  38.24 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  39.13 
 
 
382 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  31.58 
 
 
194 aa  95.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  38.97 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  42.48 
 
 
391 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  43.86 
 
 
391 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  36.3 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 
391 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  43.36 
 
 
399 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  38.41 
 
 
182 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  35.57 
 
 
190 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 
391 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 
391 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  32.03 
 
 
178 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
389 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 
374 aa  88.6  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  38.76 
 
 
178 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
389 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  36.67 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  38.33 
 
 
377 aa  85.5  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  34 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  39.82 
 
 
383 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  40 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  34.53 
 
 
376 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
394 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  39.39 
 
 
231 aa  80.5  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  33.61 
 
 
207 aa  80.5  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  35.2 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  38.1 
 
 
404 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  31.97 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  36.07 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  31.97 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.35 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  38.19 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
384 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
401 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>