More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2596 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
457 aa  932  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  64.91 
 
 
471 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  48.67 
 
 
468 aa  416  1e-115  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  37.22 
 
 
457 aa  326  4e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  36.1 
 
 
457 aa  319  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  37.64 
 
 
461 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
459 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  34.8 
 
 
455 aa  186  1e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  34.8 
 
 
455 aa  186  1e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  36.77 
 
 
453 aa  184  4e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
445 aa  183  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.68 
 
 
471 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 
466 aa  179  6e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
429 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
467 aa  175  1e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  37.01 
 
 
429 aa  175  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
455 aa  174  4e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  29.72 
 
 
445 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
449 aa  173  7e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
449 aa  172  8e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  35.92 
 
 
458 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  37.32 
 
 
449 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
458 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  37.09 
 
 
449 aa  169  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  35.82 
 
 
458 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
458 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
459 aa  167  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
454 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
445 aa  166  6e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
435 aa  166  7e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  9.971e-12 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  33.68 
 
 
453 aa  165  1e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  34.45 
 
 
472 aa  165  1e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  26.41 
 
 
465 aa  165  2e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  36.45 
 
 
456 aa  164  2e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  31.67 
 
 
452 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  34.71 
 
 
480 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
455 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
449 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  31.85 
 
 
416 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  32.25 
 
 
412 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  33.68 
 
 
449 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
463 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.68 
 
 
465 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
471 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  32.98 
 
 
449 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
433 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
449 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
389 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
455 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  24.34 
 
 
446 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
423 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  27.7 
 
 
446 aa  154  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
463 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
442 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  25.76 
 
 
458 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  34.8 
 
 
457 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  34.8 
 
 
457 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  34.8 
 
 
457 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  34.8 
 
 
457 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  34.8 
 
 
457 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
449 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  34.8 
 
 
457 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  34.43 
 
 
457 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  34.8 
 
 
457 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  34.43 
 
 
457 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60495e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  34.43 
 
 
457 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  34.43 
 
 
457 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
419 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
420 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
439 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  34.43 
 
 
457 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  34.43 
 
 
457 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  34.07 
 
 
457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
457 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
421 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  34.07 
 
 
457 aa  147  4e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  34.69 
 
 
456 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  35.16 
 
 
456 aa  146  7e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  33.7 
 
 
457 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  34.32 
 
 
456 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
444 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
440 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
454 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  31.78 
 
 
365 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  33.95 
 
 
456 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  32.97 
 
 
458 aa  142  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  32.97 
 
 
458 aa  142  1e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  32.97 
 
 
458 aa  142  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
442 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  26.18 
 
 
468 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
446 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  5.01512e-05  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
446 aa  137  6e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  28.3 
 
 
443 aa  136  7e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
448 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
458 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
472 aa  135  1e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
446 aa  135  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  1.82562e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
456 aa  135  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
456 aa  134  2e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>