132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2470 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
282 aa  583  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.51 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.07 
 
 
280 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.7 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.74 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.74 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  29.96 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  28.81 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  28.81 
 
 
297 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  37.59 
 
 
144 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  36.57 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  40.96 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  33.55 
 
 
132 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  37.5 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  34.72 
 
 
132 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  34.72 
 
 
132 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 
197 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.41 
 
 
365 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  29.73 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  32.86 
 
 
162 aa  62.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.56 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.1 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  34.96 
 
 
132 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  40.45 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.48 
 
 
478 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.11 
 
 
181 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.14 
 
 
181 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  28.48 
 
 
478 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  38.71 
 
 
132 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.46 
 
 
181 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.64 
 
 
165 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.11 
 
 
181 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.11 
 
 
181 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.11 
 
 
181 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.42 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  33.59 
 
 
132 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.45 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.82 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.21 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.11 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.51 
 
 
169 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  34.09 
 
 
157 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.26 
 
 
150 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 
152 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  32.85 
 
 
189 aa  55.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  32.41 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  34.15 
 
 
187 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  32.41 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  32.41 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0330  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.51 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0518178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  32.41 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.71 
 
 
183 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  32.41 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  31 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.98 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.46 
 
 
204 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.68 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  38.24 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  35.05 
 
 
224 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.36 
 
 
234 aa  52.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  35.05 
 
 
182 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  35.05 
 
 
182 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  35.05 
 
 
182 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  35.05 
 
 
182 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  35.05 
 
 
182 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  35.05 
 
 
182 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 
154 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.7 
 
 
126 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  31.2 
 
 
173 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  31.2 
 
 
173 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 
190 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  29.31 
 
 
190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.1 
 
 
146 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  29.31 
 
 
190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  29.31 
 
 
190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  29.31 
 
 
190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  29.31 
 
 
185 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  29.31 
 
 
190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  29.31 
 
 
190 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.29 
 
 
220 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.35 
 
 
221 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.81 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.31 
 
 
171 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.82 
 
 
524 aa  49.3  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  38.82 
 
 
144 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.23 
 
 
132 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.96 
 
 
234 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  31.13 
 
 
133 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.21 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  35.71 
 
 
141 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.7 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.21 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.21 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  31.15 
 
 
163 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.36 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.85 
 
 
145 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>