19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2458 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  80.1 
 
 
199 aa  344  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  67.5 
 
 
208 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  64.65 
 
 
224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  58.82 
 
 
199 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  57.28 
 
 
213 aa  238  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  41.5 
 
 
206 aa  168  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.47 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  22.34 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  31.2 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  21.39 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  22.55 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  22.16 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24.39 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  22.48 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  20.77 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  23.98 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  21.51 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  26.72 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>