115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2457 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  603  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  53.52 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.38 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.77 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  30.86 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  41.79 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.35 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 1072 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  31.28 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.58 
 
 		 864 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 974 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 635 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.18 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 1089 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 128 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 508 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.7 
 
 		 249 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.72 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  50 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  38 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.15 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1457  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein family protein  43.08 
 
 		 473 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000050747  normal  0.073975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.85 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  48.39 
 
 		 224 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36 
 
 		 382 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  42.19 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  43.1 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0927  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.62 
 
 		 432 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000328138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.46 
 
 		 447 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  45.61 
 
 		 462 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.68 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.26 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  44.07 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1637  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.15 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000221895  hitchhiker  0.00347843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  44.83 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  45.16 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.08 
 
 		 792 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.98 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.86 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 160 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.63 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  48.28 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.19 
 
 		 531 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 629 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  44.83 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.1 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 143 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 170 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  41.38 
 
 		 409 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  38.98 
 
 		 387 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  42.86 
 
 		 381 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  43.1 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  41.38 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.13 
 
 		 567 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  39.29 
 
 		 406 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1399  peptidase M23B  25.83 
 
 		 945 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.173601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.05 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1791  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.81 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  51.11 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  38.6 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 528 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  39.66 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 422 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.85 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.27 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  44.83 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  33.72 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.22 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  43.1 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2207  hypothetical protein  23.43 
 
 		 938 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.14 
 
 		 762 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.28 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3137  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 524 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  29.49 
 
 		 572 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2364  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 		 92 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>