239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2445 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  899    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  46.47 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  47.09 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  45.97 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  46.32 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  45.26 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  45.61 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  45 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  45.07 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  46.32 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  44.08 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  44.44 
 
 		 425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  44.31 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  46 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  44.34 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  43.45 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  43.84 
 
 		 459 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  43.28 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  43.41 
 
 		 723 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  42.35 
 
 		 415 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  43.47 
 
 		 432 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  46.93 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  43.53 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  43.24 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  42.33 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  41.35 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  43.63 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  43.73 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  42.79 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  43.49 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  41.61 
 
 		 470 aa  346  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  42.82 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  43.6 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  42.22 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  44.96 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  41.84 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  42.47 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  42.82 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  42.92 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  44.74 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  42.59 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  43.2 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  43.98 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  42.52 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  40.83 
 
 		 453 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  42.75 
 
 		 420 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  40.33 
 
 		 418 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  42.13 
 
 		 451 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  42.13 
 
 		 411 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  41.39 
 
 		 408 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  41.04 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  40.79 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  40.94 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  41.69 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  42.79 
 
 		 412 aa  328  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  41.74 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  41.9 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  42.28 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  39.86 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  41.41 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  41.38 
 
 		 420 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  40.68 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  40.69 
 
 		 383 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  41.13 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  41.59 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  41.26 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  41.05 
 
 		 414 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  40 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  41.18 
 
 		 408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  41.23 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  40.98 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  41.39 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  41.39 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  40.09 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  37.44 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  40.25 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  40.7 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  41.63 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  33.41 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  29.29 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  28.74 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  28.73 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  28.84 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  29.9 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  28.76 
 
 		 374 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  28.16 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  27.83 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  27.89 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  26.76 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  28.98 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  28.21 
 
 		 506 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  25.89 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.53 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  27.09 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  28.94 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  27.97 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 416 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  25.9 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  26.38 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  26.34 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>