More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2373 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.09 
 
 
629 aa  959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
628 aa  1271    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.56 
 
 
629 aa  964    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  72.9 
 
 
630 aa  926    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.09 
 
 
629 aa  960    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.56 
 
 
629 aa  964    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  57.26 
 
 
489 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  56.46 
 
 
534 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  48.79 
 
 
535 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.84 
 
 
540 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1522  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  52.22 
 
 
402 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.858341  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  48.91 
 
 
403 aa  389  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176221  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  52.21 
 
 
524 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  52.02 
 
 
663 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0978  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.56 
 
 
514 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000974435  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.88 
 
 
397 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.27 
 
 
558 aa  363  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.14 
 
 
597 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13460  subtilisin-like serine protease  48.61 
 
 
403 aa  346  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  49.23 
 
 
586 aa  345  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.91 
 
 
518 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.38 
 
 
391 aa  343  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  48.28 
 
 
514 aa  343  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.14 
 
 
519 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1838  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.28 
 
 
519 aa  337  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0716705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.18 
 
 
519 aa  330  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.77 
 
 
596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.83 
 
 
563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0029  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.28 
 
 
411 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4308  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  43.92 
 
 
380 aa  319  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  46.25 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0312  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.5 
 
 
484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2054  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.63 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6261  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.3 
 
 
427 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2666  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.56 
 
 
731 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2268  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.09 
 
 
507 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.0271027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2269  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.82 
 
 
461 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.778693  normal  0.0483153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.42 
 
 
404 aa  293  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.600934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1717  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.87 
 
 
381 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3063  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.42 
 
 
833 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561591  normal  0.891031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1037  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.07 
 
 
393 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2012  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.1 
 
 
514 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10030  hypothetical serine protease (Eurofung)  36.4 
 
 
477 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.632842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  48.32 
 
 
801 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78783  vacuolar protease B  46.87 
 
 
544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0089514  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00620  serine-type endopeptidase, putative  45.78 
 
 
518 aa  253  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_4493  predicted protein  43.24 
 
 
449 aa  250  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0320757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3551  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.86 
 
 
396 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00861424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2843  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.43 
 
 
404 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0208392  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3798  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.25 
 
 
522 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412702  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48496  predicted protein  40.1 
 
 
460 aa  239  9e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.93 
 
 
442 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.883055  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.89 
 
 
514 aa  238  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0802197  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.65 
 
 
494 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  38.92 
 
 
521 aa  237  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1252  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.48 
 
 
399 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.963928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.95 
 
 
395 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.43 
 
 
579 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05558  Alkaline proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00208]  42.23 
 
 
403 aa  232  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38 
 
 
377 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5785  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.8 
 
 
401 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48491  predicted protein  40.38 
 
 
401 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131645  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  42.51 
 
 
472 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  51.96 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.92 
 
 
555 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  43.58 
 
 
488 aa  208  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.32 
 
 
551 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  39.5 
 
 
582 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  43.38 
 
 
789 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48484  predicted protein  38.8 
 
 
380 aa  196  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00786628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.13 
 
 
520 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  40.41 
 
 
789 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  33.48 
 
 
533 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  31.97 
 
 
560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28842  predicted protein  46.15 
 
 
398 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991697  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.49 
 
 
583 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  46.94 
 
 
658 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.3 
 
 
399 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14380  predicted protein  42.11 
 
 
247 aa  175  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.55072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.77 
 
 
495 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.75 
 
 
407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.16 
 
 
396 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.15 
 
 
407 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264127  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  37.8 
 
 
454 aa  160  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.81 
 
 
595 aa  160  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
617 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3301  putative serine protease  38.34 
 
 
407 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  33.52 
 
 
408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  42.05 
 
 
1315 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
601 aa  154  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.63 
 
 
587 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  37.5 
 
 
397 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  36.86 
 
 
397 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  38.69 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  38.69 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  38.69 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  38.69 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  38.69 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  37.5 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44226  predicted protein  36.39 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0107542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>