More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2273 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  68.48 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  68.24 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  68.24 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  68.24 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  68.24 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  67.84 
 
 		 258 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  66.41 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  66.8 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  66.8 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  66.41 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  67.05 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 		 258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  59.14 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  61.66 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  58.66 
 
 		 262 aa  315  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  60.08 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  47.69 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  46.88 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  43.62 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  39.84 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  42.8 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  43.62 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  43.62 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  43.62 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  43.62 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  43.87 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  43.85 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  44.26 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  44.26 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  43.48 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  44.26 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  44.26 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  43.48 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  43.21 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  43.21 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  43.85 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  42.62 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  41.34 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  42.8 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  39.68 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  43.1 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  40.61 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  42.39 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  39.84 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  38.98 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  38.98 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  38.19 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  37.7 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  37.55 
 
 		 311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.55 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  37.55 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  34.54 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  34.03 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.56 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  32.8 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  31.1 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  29.52 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  26.87 
 
 		 356 aa  86.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.03 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  25.9 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.31 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.23 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>