More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2226 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 		 467 aa  975    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  67.88 
 
 		 469 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  64.45 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.66 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.66 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.95 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.87 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  63.44 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  63.17 
 
 		 467 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  63.6 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  62.53 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1903  para-aminobenzoate synthase, subunit I  62.11 
 
 		 477 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.757454  hitchhiker  0.000298864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  57.29 
 
 		 490 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  60 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  60.74 
 
 		 471 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  57.91 
 
 		 509 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  55.53 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  55.65 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.43 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  55.65 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.43 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  55.87 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  55.43 
 
 		 453 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  55.65 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  55.16 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  55.38 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  55.22 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  54.03 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  54.48 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  54.03 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  55.31 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  54.03 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.76 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  54.05 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.32 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0559129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.27 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  53.08 
 
 		 497 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  53.5 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  53.03 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  53.03 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  52.81 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  52.81 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  53.95 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.09 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  52.81 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.34 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  48.24 
 
 		 460 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0453  para-aminobenzoate synthase, component I  48.09 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0249447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  46.3 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  44.44 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  45.45 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  43.17 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.28 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  43.82 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  48.83 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.28 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.18 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.17 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.39 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.08 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.17 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.05 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.67 
 
 		 450 aa  362  8e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  41.05 
 
 		 443 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  44.02 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.54 
 
 		 474 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  41.63 
 
 		 430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  41.63 
 
 		 430 aa  339  7e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.82 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  40.89 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.89 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.36 
 
 		 466 aa  310  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  36.74 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.4 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.5 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.95 
 
 		 721 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.75 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1469  hypothetical protein  37.86 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1514  hypothetical protein  36.97 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  36.22 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  36.12 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.07 
 
 		 444 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.6 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.43 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.79 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.57 
 
 		 741 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.32 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.86 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  36.11 
 
 		 465 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.43 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.43 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.2 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  36.3 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.66 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  35.4 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  35.97 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  35.97 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  35.97 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  35.97 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>