More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2215 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1110 aa  2294    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  62.81 
 
 
1090 aa  1380    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  47.62 
 
 
1161 aa  746    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.9 
 
 
1155 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  44.88 
 
 
1150 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  44.57 
 
 
663 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  44.87 
 
 
773 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  44.75 
 
 
876 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.96 
 
 
1091 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
1104 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  43.06 
 
 
914 aa  532  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  43.42 
 
 
1134 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  43.21 
 
 
918 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  43.63 
 
 
1080 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  45.6 
 
 
1126 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 
1108 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  44.9 
 
 
1178 aa  515  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 
1113 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  41.89 
 
 
1113 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  42.79 
 
 
1100 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  43.25 
 
 
872 aa  509  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  43.83 
 
 
1105 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  43.83 
 
 
666 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.3 
 
 
1088 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.12 
 
 
1088 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
1105 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.68 
 
 
1086 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  43.21 
 
 
896 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 
1120 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  41.5 
 
 
1082 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  41.5 
 
 
1082 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  41.65 
 
 
1082 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  41.23 
 
 
1088 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.28 
 
 
1073 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  40.87 
 
 
1070 aa  482  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  41.47 
 
 
1070 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  42.32 
 
 
1086 aa  476  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 
1073 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 
1073 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 
1073 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  40.73 
 
 
1209 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 
1073 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  40.74 
 
 
991 aa  466  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  40.33 
 
 
777 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.02 
 
 
1069 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.72 
 
 
1068 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  39.29 
 
 
1068 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.94 
 
 
1071 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
1091 aa  416  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
1068 aa  416  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
1112 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.79 
 
 
1062 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 
1055 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 
982 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  41.18 
 
 
1087 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  42.09 
 
 
1021 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.38 
 
 
1112 aa  379  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  42.12 
 
 
977 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 
1082 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  40.43 
 
 
1031 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
1139 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.58 
 
 
1003 aa  370  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.92 
 
 
1068 aa  367  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  36.99 
 
 
1130 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.91 
 
 
1127 aa  366  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
1129 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  40.23 
 
 
964 aa  363  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.49 
 
 
1082 aa  360  7e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  39.01 
 
 
1125 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  42.55 
 
 
924 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
1261 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  36.22 
 
 
1386 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  35.83 
 
 
1362 aa  352  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  39.57 
 
 
1250 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  38.39 
 
 
1181 aa  351  6e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.64 
 
 
1077 aa  349  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.17 
 
 
925 aa  350  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  41.13 
 
 
918 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  41.13 
 
 
918 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.76 
 
 
1084 aa  344  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 
1069 aa  343  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  41.6 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  41.8 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 
918 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  41.05 
 
 
918 aa  341  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  41.6 
 
 
918 aa  341  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
1089 aa  340  9e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.39 
 
 
1110 aa  339  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40.86 
 
 
918 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40.86 
 
 
918 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40.86 
 
 
918 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  39.8 
 
 
959 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 
918 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.97 
 
 
933 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40 
 
 
1102 aa  337  7.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.71 
 
 
1403 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 
1047 aa  335  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  39.21 
 
 
1066 aa  334  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  35.01 
 
 
1047 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  40.47 
 
 
985 aa  333  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>