70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2202 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  68.16 
 
 		 518 aa  718    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  73.06 
 
 		 551 aa  808    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  74.71 
 
 		 531 aa  809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  73.62 
 
 		 529 aa  805    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  73.51 
 
 		 524 aa  800    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  73.06 
 
 		 551 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  72.88 
 
 		 551 aa  805    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  73.06 
 
 		 551 aa  808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  100 
 
 		 551 aa  1120    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 530 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  72.39 
 
 		 519 aa  769    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  74.71 
 
 		 531 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  74.9 
 
 		 531 aa  808    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  60.54 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  56.4 
 
 		 505 aa  578  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  57.31 
 
 		 507 aa  576  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  57.89 
 
 		 501 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  56.54 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  56.61 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 509 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  61.03 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  58.82 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  53.36 
 
 		 457 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  49.38 
 
 		 498 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  47.28 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  50.27 
 
 		 428 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  38.46 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  39.91 
 
 		 450 aa  170  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  39.46 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  35.06 
 
 		 471 aa  168  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  34.48 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 461 aa  160  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  38.63 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  38.79 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  27.15 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.47 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 415 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 461 aa  51.2  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 426 aa  50.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 		 674 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.79 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 435 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.97 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  29.17 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.74 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 460 aa  43.9  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  32.39 
 
 		 454 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.35 
 
 		 411 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  41.3 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  22.12 
 
 		 536 aa  43.5  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>