More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2149 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  57.77 
 
 
569 aa  660  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  57.57 
 
 
582 aa  666  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  58.06 
 
 
577 aa  672  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2467  ATP-dependent protease  71.38 
 
 
580 aa  827  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00344984  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  57.71 
 
 
577 aa  672  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.00505e-07  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  57.89 
 
 
577 aa  673  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.55632e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  57.04 
 
 
582 aa  662  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.44541e-07  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  58.23 
 
 
577 aa  675  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.49813e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  58.09 
 
 
577 aa  667  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  57.57 
 
 
582 aa  665  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.99604e-05  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  100 
 
 
543 aa  1125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.59451e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  59.3 
 
 
570 aa  676  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  57.54 
 
 
577 aa  670  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  55.61 
 
 
596 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  55.06 
 
 
599 aa  631  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.27268e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  55.11 
 
 
576 aa  607  1e-172  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.40956e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  38.02 
 
 
831 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.65888e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.64 
 
 
802 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  38.13 
 
 
832 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  39.74 
 
 
829 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  39.1 
 
 
817 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  39.46 
 
 
806 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  38.88 
 
 
817 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  39.91 
 
 
813 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.84 
 
 
816 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  35.01 
 
 
803 aa  291  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  38.44 
 
 
811 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  39.69 
 
 
812 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  37.47 
 
 
786 aa  289  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  38.02 
 
 
800 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.99 
 
 
807 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  38.22 
 
 
811 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.61 
 
 
801 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  36.4 
 
 
814 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  35.63 
 
 
786 aa  286  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  38.5 
 
 
806 aa  286  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.28 
 
 
795 aa  284  4e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  36.53 
 
 
786 aa  282  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.5 
 
 
805 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.7 
 
 
810 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  37.62 
 
 
827 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  37.27 
 
 
805 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.27 
 
 
805 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  38.39 
 
 
799 aa  280  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  37.9 
 
 
813 aa  280  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  36.63 
 
 
809 aa  279  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  37.36 
 
 
805 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.45 
 
 
805 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  37.13 
 
 
805 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.13 
 
 
805 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  35.74 
 
 
818 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.24 
 
 
843 aa  275  1e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.69 
 
 
865 aa  275  2e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  38.34 
 
 
590 aa  274  4e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.64824e-07  decreased coverage  6.03795e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  37.21 
 
 
791 aa  273  5e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  36.29 
 
 
861 aa  273  5e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  36.34 
 
 
812 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  36.34 
 
 
812 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  36.57 
 
 
777 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  36.34 
 
 
812 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  38.22 
 
 
803 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  35.96 
 
 
802 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  41.18 
 
 
583 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.94909e-10  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  36.18 
 
 
844 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  41.18 
 
 
583 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.61 
 
 
812 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  41.18 
 
 
540 aa  270  6e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  5.10666e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  37.78 
 
 
810 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  35.55 
 
 
546 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.34026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  34.85 
 
 
811 aa  267  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  36.4 
 
 
808 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.32 
 
 
807 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  36.61 
 
 
815 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  34.83 
 
 
825 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  37.7 
 
 
589 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.2938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.94 
 
 
806 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  36.15 
 
 
814 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.17 
 
 
788 aa  262  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  35.33 
 
 
811 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.35674e-05  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  37.19 
 
 
546 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  35.32 
 
 
821 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  35.39 
 
 
809 aa  260  5e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  37.8 
 
 
598 aa  260  5e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  36.02 
 
 
795 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  40.46 
 
 
784 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.95 
 
 
805 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  35.82 
 
 
810 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  33.9 
 
 
798 aa  259  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  39.48 
 
 
819 aa  259  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  36.24 
 
 
797 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  33.56 
 
 
873 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  34.48 
 
 
798 aa  257  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.43 
 
 
813 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  34.74 
 
 
786 aa  256  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  35.96 
 
 
589 aa  255  1e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  35.89 
 
 
660 aa  254  2e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  36.61 
 
 
575 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  33.94 
 
 
819 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  33.92 
 
 
787 aa  254  4e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  33.13 
 
 
823 aa  253  8e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>