215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2114 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  100 
 
 
221 aa  444  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.40493e-08  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  82.35 
 
 
221 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.41313e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  79.19 
 
 
221 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.57088e-08  unclonable  1.64505e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  73.3 
 
 
236 aa  340  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  74.21 
 
 
221 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.46493e-08  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  74.21 
 
 
221 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.61193e-10  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  74.21 
 
 
221 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.24722e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  74.21 
 
 
221 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.0137e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  73.3 
 
 
221 aa  327  1e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.19e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  72.4 
 
 
221 aa  326  2e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.20942e-09  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  72.4 
 
 
221 aa  325  4e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.73215e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  72.4 
 
 
221 aa  325  4e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.25523e-05  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  70.59 
 
 
221 aa  320  1e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  67.27 
 
 
221 aa  295  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  68.3 
 
 
224 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.56846e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  66.52 
 
 
221 aa  288  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  45.45 
 
 
220 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  44.55 
 
 
220 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.71161e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  44.39 
 
 
220 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  7.16221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  44.34 
 
 
221 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  40 
 
 
235 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  40 
 
 
235 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  40 
 
 
235 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  40 
 
 
235 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.46885e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  40 
 
 
235 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  43.48 
 
 
228 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.96174e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  43.48 
 
 
228 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.53282e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  43.48 
 
 
228 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  40.95 
 
 
233 aa  157  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.9542e-10  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  42.41 
 
 
225 aa  157  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  40.85 
 
 
235 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  37.66 
 
 
236 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.89797e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  42.24 
 
 
232 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  37.66 
 
 
231 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  37.66 
 
 
231 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  37.66 
 
 
231 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  37.66 
 
 
231 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  40.27 
 
 
239 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  45.32 
 
 
228 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  3.99265e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  38.2 
 
 
231 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  6.84881e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  38.2 
 
 
231 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  7.72871e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  38.2 
 
 
231 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.46927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  38.2 
 
 
236 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  4.08843e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  43.84 
 
 
228 aa  147  1e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.71298e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  41.38 
 
 
233 aa  145  4e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  38.22 
 
 
231 aa  144  8e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  38.5 
 
 
228 aa  139  4e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.38053e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  33.47 
 
 
243 aa  137  9e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  34.62 
 
 
244 aa  136  3e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  36.17 
 
 
241 aa  136  3e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  40 
 
 
242 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  34.58 
 
 
253 aa  128  7e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  32.03 
 
 
242 aa  127  9e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  35.84 
 
 
227 aa  127  1e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  35.04 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  34.62 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  35.06 
 
 
248 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  33.73 
 
 
263 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  35.32 
 
 
245 aa  124  8e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  35.06 
 
 
240 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  33.33 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  5.94989e-14 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  36.89 
 
 
238 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  33.33 
 
 
242 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0965  septum formation inhibitor  36 
 
 
231 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  35.43 
 
 
263 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  31.01 
 
 
257 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  33.48 
 
 
236 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  33.74 
 
 
241 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  33.48 
 
 
236 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  36.28 
 
 
238 aa  121  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  34.19 
 
 
248 aa  120  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  33.33 
 
 
238 aa  120  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  32.77 
 
 
249 aa  120  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6586  septum formation inhibitor  35.59 
 
 
239 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  34.4 
 
 
262 aa  117  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  33.05 
 
 
247 aa  117  2e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  32.02 
 
 
259 aa  115  4e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5650  septum formation inhibitor  34.63 
 
 
240 aa  115  4e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177009  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  33.9 
 
 
242 aa  115  4e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04463  septum formation inhibitor  34.76 
 
 
243 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  32.35 
 
 
253 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  31.28 
 
 
255 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  32.5 
 
 
255 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  31.28 
 
 
255 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  32.35 
 
 
275 aa  113  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0501  septum formation inhibitor  31.44 
 
 
237 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0711428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0009  septum site-determining protein MinC  33.06 
 
 
256 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.274749 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  37.62 
 
 
243 aa  110  1e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  34.58 
 
 
268 aa  110  1e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  32.92 
 
 
262 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  37.69 
 
 
227 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  34.31 
 
 
251 aa  108  7e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  32.23 
 
 
253 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  35.75 
 
 
265 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  31.91 
 
 
261 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0504  septum formation inhibitor  31.91 
 
 
261 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.694203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  34.29 
 
 
261 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1704  septum site-determining protein MinC  33.76 
 
 
244 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  31.52 
 
 
261 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  31.34 
 
 
270 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>