177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2079 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  60.94 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  54.59 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  25.94 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  26.36 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  25.94 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  28.02 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  28.64 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.78 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  28.02 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.51 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.98 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  27.16 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  27.16 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  28.46 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  27.03 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  27.52 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  27.52 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  27.52 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  27.52 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  25.6 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  24.66 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0527  hypothetical protein  25.78 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.56 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  28.57 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  23.64 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  25.88 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  25.63 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.36 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.75 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  24.19 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0286  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  27.61 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  25.6 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  20.96 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.22 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  23.39 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  24.22 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.75 
 
 		 675 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  24.08 
 
 		 830 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  23.81 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3279  hypothetical protein  26.46 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0523895  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  23.11 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  22.91 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  24.9 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  24.61 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 457 aa  52  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3285  putative amino acid ABC transporter  25.41 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  27.88 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  25 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  27.11 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3893  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.61 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  29.45 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  26.9 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.81 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1595  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  28.77 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  27.09 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  23.85 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  28.77 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  22.08 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  29.91 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  22.67 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>