39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2075 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  37.99 
 
 
186 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  32.62 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  29.9 
 
 
202 aa  69.7  2e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  28.07 
 
 
221 aa  64.3  1e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  29.73 
 
 
185 aa  60.1  2e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  30.22 
 
 
187 aa  59.3  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  30.22 
 
 
187 aa  59.3  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  30.22 
 
 
187 aa  59.3  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  30.22 
 
 
187 aa  59.3  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  27.81 
 
 
187 aa  59.3  4e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  30.22 
 
 
187 aa  58.9  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  58.2  7e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  31.03 
 
 
182 aa  57.4  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  31.03 
 
 
182 aa  57.4  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  27.27 
 
 
187 aa  56.2  3e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.74 
 
 
187 aa  55.1  6e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  55.1  6e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  55.1  6e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  55.1  6e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  26.82 
 
 
182 aa  55.1  7e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  26.82 
 
 
182 aa  55.1  7e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.74 
 
 
187 aa  54.7  8e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  27.98 
 
 
188 aa  54.3  9e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  27.87 
 
 
192 aa  54.7  9e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  27.87 
 
 
192 aa  54.7  9e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  29.73 
 
 
188 aa  54.3  1e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.73 
 
 
189 aa  52.8  3e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  26.09 
 
 
192 aa  52  5e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  23.53 
 
 
195 aa  50.4  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  23.89 
 
 
192 aa  48.9  5e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  24.16 
 
 
186 aa  48.5  5e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  27.17 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  26.92 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  23.68 
 
 
199 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  21.43 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.09 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  21.69 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.52 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>