256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2051 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2051  23S rRNA methyltransferase A  100 
 
 
274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0639711  normal  0.0300998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2615  23S rRNA methyltransferase A  77.41 
 
 
271 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00654791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  67.29 
 
 
270 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  67.41 
 
 
268 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  60.74 
 
 
273 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2788  23S rRNA methyltransferase A  60.07 
 
 
271 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2570  23S rRNA methyltransferase A  60.45 
 
 
271 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.69516  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2408  23S rRNA methyltransferase A  60.07 
 
 
271 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0949625  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2286  23S rRNA methyltransferase A  60.22 
 
 
282 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2478  23S rRNA methyltransferase A  59.7 
 
 
271 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1707  23S rRNA methyltransferase A  60.45 
 
 
271 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000156407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1704  23S rRNA methyltransferase A  60.45 
 
 
271 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000062625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2660  23S rRNA methyltransferase A  60.07 
 
 
271 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000543045  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1571  23S rRNA methyltransferase A  59.33 
 
 
271 aa  342  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1747  23S rRNA methyltransferase A  59.33 
 
 
271 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00290496  normal  0.326236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1971  23S rRNA methyltransferase A  53.53 
 
 
279 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03053  23S rRNA methyltransferase A  47.23 
 
 
317 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2820  23S rRNA methyltransferase A  45.93 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00132792  decreased coverage  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  45.39 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2376  23S rRNA methyltransferase A  44.81 
 
 
279 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.47252e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1660  23S rRNA methyltransferase A  44.81 
 
 
279 aa  248  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000847833  normal  0.340035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2472  23S rRNA methyltransferase A  44.81 
 
 
279 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.339553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1589  23S rRNA methyltransferase A  43.27 
 
 
278 aa  244  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972827  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  42.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  44.81 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  45.19 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  44.81 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  44.81 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1921  23S rRNA methyltransferase A  43.01 
 
 
276 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000726719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  43.01 
 
 
276 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  45.56 
 
 
269 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  45.56 
 
 
269 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1978  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.33 
 
 
270 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000355132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  45.19 
 
 
269 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2181  23S rRNA methyltransferase A  43.33 
 
 
269 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  43.07 
 
 
274 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3174  23S rRNA methyltransferase A  39.34 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2391  23S rRNA methyltransferase A  42.96 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0129084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3381  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  40.6 
 
 
282 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.717643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01907  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  37.59 
 
 
290 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0387238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2615  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
282 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1087  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.4 
 
 
269 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.162642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1330  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.55 
 
 
269 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.236151  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1522  rRNA large subunit methyltransferase A, putative  36.36 
 
 
269 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49390  rRNA methyltransferase  34.57 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0600503  normal  0.756715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1524  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.39 
 
 
270 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.222392 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1451  SAM-dependent methyltransferase  37.08 
 
 
271 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4200  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.39 
 
 
270 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4095  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.18 
 
 
270 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149378  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39160  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.83 
 
 
267 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4218  rRNA methyltransferase  33.46 
 
 
267 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1129  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.78 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1475  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3067  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35.07 
 
 
270 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254244  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0138  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  34.89 
 
 
320 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1334  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  33.46 
 
 
283 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1753  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  37.8 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1059  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  36.51 
 
 
282 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3178  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  33.58 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.778846  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0491  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  35 
 
 
294 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2374  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.19 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.983483  normal  0.777299 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2050  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  30.21 
 
 
313 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0968  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.75 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000856039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1980  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  30.69 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369275  normal  0.0666116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1081  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.95 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00250599  normal  0.0321173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1162  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.84 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000132162  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2637  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  32.97 
 
 
279 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0727904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1005  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.52 
 
 
274 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000007859  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0279  hypothetical protein  28.21 
 
 
302 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000809235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0404  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.36 
 
 
277 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1787  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
281 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2162  methyltransferase  29.18 
 
 
281 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0579  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
285 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0509  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
326 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.232418  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2825  methyltransferase type 11  28.31 
 
 
274 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000588613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2981  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  26.24 
 
 
279 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000243248  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3078  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  24.91 
 
 
279 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000214385  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0187  type 11 methyltransferase  28.27 
 
 
276 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1113  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.3 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0490976  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2899  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.81 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000719078  hitchhiker  0.00146676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1716  Methyltransferase type 11  27.76 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.384716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1294  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  26.02 
 
 
275 aa  99  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  31.72 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09700  methyltransferase family protein  29.88 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.635905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6121  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
311 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1197  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  25 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1230  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  25 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.706376  normal  0.528023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  25.58 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.53281  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1153  ribosomal RNA large subunit methyltransferase A, putative  25.19 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.010967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1173  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2191  methyltransferase type 11  28.94 
 
 
283 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0208544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0717  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  28.88 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  27.57 
 
 
277 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>