More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2021 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  55.45 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  56.82 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 231 aa  265  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  56.31 
 
 		 231 aa  265  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  53.6 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  57.73 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  56.02 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  56.42 
 
 		 228 aa  255  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  55 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  54.13 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  56.02 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  52.51 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  52.73 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  50 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  53.18 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  48.64 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  52.73 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  53.18 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  52.73 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  52.73 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  53.18 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  52.73 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  55 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  49.09 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  48.15 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.23 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  50.45 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  48.2 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  46.85 
 
 		 253 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.18 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  49.09 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  46.79 
 
 		 241 aa  207  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.84 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.04 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  45.09 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  44.29 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.8 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  44.14 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  43.95 
 
 		 252 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  47.71 
 
 		 277 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  49.32 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.25 
 
 		 240 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.25 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  45.91 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  44.14 
 
 		 255 aa  203  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.25 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  41.89 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.04 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  46.85 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  49.06 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.59 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.21 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.13 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  46.95 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  46.12 
 
 		 565 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  49.05 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.95 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.37 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  47.62 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.45 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.25 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.5 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  45.29 
 
 		 272 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>