28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1885 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  77.59 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  69.77 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  66.96 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  58.41 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  51.15 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  53.44 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  53.49 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  59.09 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  59.09 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  58.18 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  52.85 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  52.85 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  62.83 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  52.38 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  52.03 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  31.75 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  29.46 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  22.52 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  22.31 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  30.08 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  28.46 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  20.77 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  27.78 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0125  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 122 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  23.17 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0085  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 122 aa  40  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>