More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1869 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  74.32 
 
 		 226 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  60.79 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  60.79 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  59.47 
 
 		 231 aa  278  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  59.47 
 
 		 231 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  57.87 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  59.91 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  62.5 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  56.07 
 
 		 236 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  58.74 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  55 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  57.87 
 
 		 246 aa  247  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  57.2 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  54.09 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  56.36 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  55.74 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  53.18 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  53.64 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  52.73 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  52.27 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  51.95 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  52.27 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  52.27 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  50 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  50 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  52.49 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  50.48 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  43.72 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  47.03 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  54.85 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  51.36 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  45.33 
 
 		 234 aa  187  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  42.73 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  45.91 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  45.37 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  43.64 
 
 		 238 aa  184  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  45.45 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  47.64 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  45.74 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  47.64 
 
 		 245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  43.18 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  47.17 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  40.91 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  44.09 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  45.25 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  45.25 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  44.8 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  42.27 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  43.84 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  44.34 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  44.34 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  44.34 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  41.1 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  45.83 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  43.44 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  42.18 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  42.27 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  42.27 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  42.79 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  41.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  41.44 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  42.53 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  42.53 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  42.08 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  41.44 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  42.08 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  42.08 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  40.64 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  40.62 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  41.26 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  43.2 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2050  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.583234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01552  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  41.55 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  39.91 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  40.64 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  38.46 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>