82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1711 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  266  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  75.37 
 
 		 131 aa  203  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  70.29 
 
 		 151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  66.94 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  63.16 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  58 
 
 		 282 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  46.55 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  50.98 
 
 		 265 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  43.28 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  43.28 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  44.35 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  44.35 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  44.35 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  50.51 
 
 		 278 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  44.35 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  47.75 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  50.51 
 
 		 262 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  50.51 
 
 		 262 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  50 
 
 		 267 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  49 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  46.73 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  41.07 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  35.51 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.7 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  31.91 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  34.07 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  32.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.69 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  30.25 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  31.68 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  31.86 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  28.72 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.72 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  34.07 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  36 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  28.97 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  29.47 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  27.72 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  29.35 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  29.36 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  26.92 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  26.6 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  24.77 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  24.77 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  27.62 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  31.07 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  28.42 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  27.35 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  23.26 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  22.73 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  28.18 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  31.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  31.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  31.58 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  20.83 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  31.19 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  27.37 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  25.64 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  34.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  28.21 
 
 		 157 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.47 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  23.21 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  27.17 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  23.21 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  28.21 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  29.47 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  26.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  24.55 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  24.55 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  29.21 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>