174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1706 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  80.16 
 
 		 248 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  80.49 
 
 		 246 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  77.46 
 
 		 247 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  77.11 
 
 		 260 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  73.28 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  74.58 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  73.33 
 
 		 252 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  75 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  75 
 
 		 254 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  74.58 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  72.02 
 
 		 252 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  73.75 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  73.75 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  69.01 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  344  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  344  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  341  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  63.52 
 
 		 245 aa  341  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  66.8 
 
 		 245 aa  335  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  330  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  61.07 
 
 		 245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  324  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  64.75 
 
 		 245 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  59.5 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  47.86 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  47.03 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  45.9 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  44.74 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  44.08 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  43.6 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  40.98 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  40.43 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  40.98 
 
 		 251 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  41.18 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  42.49 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  41.45 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  41.2 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  42.74 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  42.74 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  41.48 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  41.42 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  35.62 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  37.72 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  32.91 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  36.48 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  30.47 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  31.76 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  26.64 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  26.98 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  30.17 
 
 		 584 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  29.69 
 
 		 573 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  28.79 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  31.55 
 
 		 574 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.64 
 
 		 580 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  26.69 
 
 		 572 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  28.63 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  30.72 
 
 		 578 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  25.94 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  25.94 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  25.94 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  25.94 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  31.74 
 
 		 579 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  25.94 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  25.94 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  25.52 
 
 		 573 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  25.52 
 
 		 572 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  28.81 
 
 		 592 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  27.69 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  27.16 
 
 		 578 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  28.65 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  31.93 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  28.38 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  28.29 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  26.09 
 
 		 574 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  25.52 
 
 		 572 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  25.52 
 
 		 572 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  28.93 
 
 		 572 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  28.12 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  29.34 
 
 		 580 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  26.58 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  24.89 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  29.01 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  31.36 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  25.76 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>