More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1631 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  80.37 
 
 
377 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  85.15 
 
 
377 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  100 
 
 
377 aa  774    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  78.51 
 
 
377 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  77.19 
 
 
377 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  76.39 
 
 
377 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  77.41 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1295  flagellar biosynthesis protein FlhB  77.13 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.388157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1362  flagellar biosynthesis protein FlhB  77.13 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.873498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1355  flagellar biosynthesis protein FlhB  76.86 
 
 
376 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.424725  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  75.76 
 
 
376 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  75.48 
 
 
376 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  75.48 
 
 
376 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  75.48 
 
 
376 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  74.93 
 
 
376 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2284  flagellar biosynthesis protein FlhB  73.74 
 
 
377 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562852  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  57.03 
 
 
376 aa  441  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  56.08 
 
 
376 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  55.82 
 
 
376 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.6 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.85 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  52 
 
 
378 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  49.87 
 
 
378 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.28 
 
 
378 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.76 
 
 
374 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.89 
 
 
378 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  51.58 
 
 
376 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.58 
 
 
390 aa  359  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.94 
 
 
384 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.36 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.79 
 
 
377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.68 
 
 
380 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  44.2 
 
 
374 aa  342  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.3 
 
 
378 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.41 
 
 
380 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.62 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.41 
 
 
378 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.62 
 
 
383 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1514  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.62 
 
 
380 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.24 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.45 
 
 
391 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.77 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.65 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.38 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.63 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.74 
 
 
380 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.18 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  42.9 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.27 
 
 
381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.4 
 
 
380 aa  301  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.16 
 
 
399 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.13 
 
 
383 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.13 
 
 
383 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.48 
 
 
379 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.13 
 
 
383 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.13 
 
 
383 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.77 
 
 
387 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.67 
 
 
383 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.13 
 
 
383 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.82 
 
 
399 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.27 
 
 
403 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.55 
 
 
399 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0175  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.09 
 
 
399 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.19 
 
 
383 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.6 
 
 
383 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.8 
 
 
383 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  39.73 
 
 
387 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.7 
 
 
382 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.01 
 
 
405 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.84 
 
 
387 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.9 
 
 
380 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.84 
 
 
387 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.47 
 
 
406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 
376 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.55 
 
 
401 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.55 
 
 
401 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.55 
 
 
401 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.55 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.55 
 
 
401 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.2 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.2 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.27 
 
 
386 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1309  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.27 
 
 
392 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.791915  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.27 
 
 
386 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.1 
 
 
376 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.05 
 
 
382 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.77 
 
 
376 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3596  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.35 
 
 
374 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189893  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2977  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.32 
 
 
398 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  39.21 
 
 
375 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001177  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.52 
 
 
375 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.24 
 
 
360 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1307  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.32 
 
 
382 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0569687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1760  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.32 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.32 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2112  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.32 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01840  hypothetical protein  40.32 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1975  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.32 
 
 
382 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>