More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1580 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  87.78 
 
 		 352 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 352 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  67.14 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  65.53 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  63.43 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  63.43 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  61.82 
 
 		 351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  59.43 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  55.98 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  55.98 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  51.29 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  48.07 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  47.2 
 
 		 361 aa  331  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  44.28 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  44.61 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  41 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  44.44 
 
 		 320 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  41.23 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  41.62 
 
 		 367 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  42.9 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  40.29 
 
 		 476 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  37.68 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  37.79 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  36.73 
 
 		 341 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  38.67 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.66 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 351 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 238 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 827 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.33 
 
 		 818 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  36.09 
 
 		 784 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  36.09 
 
 		 784 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 833 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 833 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.65 
 
 		 784 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.65 
 
 		 784 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.65 
 
 		 784 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.65 
 
 		 784 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.65 
 
 		 784 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 		 820 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 		 816 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.78 
 
 		 784 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 784 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.78 
 
 		 784 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 		 854 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  33.33 
 
 		 832 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 843 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  34.93 
 
 		 828 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 		 818 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  31.74 
 
 		 229 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  34.33 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.31 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 828 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.75 
 
 		 828 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  34.98 
 
 		 240 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.6 
 
 		 828 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  32.75 
 
 		 827 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  34.33 
 
 		 365 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 		 835 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  34.21 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 821 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 835 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 830 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 		 785 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  32.62 
 
 		 820 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 836 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 		 841 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 834 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 843 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 712 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  33.47 
 
 		 842 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  34.87 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.33 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 238 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.62 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 832 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 835 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 836 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  32.31 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 		 832 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  32.34 
 
 		 842 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  32.29 
 
 		 243 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  31.58 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  32.49 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 841 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  32.9 
 
 		 830 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 835 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>