73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1575 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  44.69 
 
 		 821 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  42.27 
 
 		 820 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  100 
 
 		 833 aa  1709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 		 822 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  43.49 
 
 		 823 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  68.75 
 
 		 841 aa  1220    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  42.46 
 
 		 822 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  38.45 
 
 		 826 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  38.69 
 
 		 826 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  38.61 
 
 		 824 aa  567  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  36.8 
 
 		 825 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  33.17 
 
 		 841 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 839 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 826 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 826 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  29.13 
 
 		 837 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  27.33 
 
 		 833 aa  286  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  25.87 
 
 		 812 aa  235  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  30.58 
 
 		 871 aa  187  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  28.63 
 
 		 629 aa  85.1  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  32.52 
 
 		 616 aa  85.1  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  24.63 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  24.57 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  26.79 
 
 		 446 aa  72  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  29.57 
 
 		 578 aa  70.5  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  26.88 
 
 		 623 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  24.84 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.47 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  24.03 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  24.84 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  24.84 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  28.72 
 
 		 578 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  29.09 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  23.97 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  29.11 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.92 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  27.54 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  24.19 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  25.21 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.32 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  22.76 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  26.92 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  24.8 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  22.98 
 
 		 891 aa  58.5  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  29.38 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  27.45 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  23.51 
 
 		 635 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.49 
 
 		 758 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.37 
 
 		 431 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  23.56 
 
 		 608 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  27.91 
 
 		 629 aa  55.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  26.34 
 
 		 649 aa  54.7  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  22.69 
 
 		 440 aa  54.7  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  21.56 
 
 		 702 aa  54.3  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.28 
 
 		 632 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  29.01 
 
 		 625 aa  52.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1179 aa  52  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  27.12 
 
 		 673 aa  52  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  22.57 
 
 		 433 aa  50.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  31.51 
 
 		 577 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  25 
 
 		 626 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  28.93 
 
 		 638 aa  48.9  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.8 
 
 		 545 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.26 
 
 		 676 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  23.31 
 
 		 653 aa  45.8  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.72 
 
 		 577 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.72 
 
 		 577 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1192 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  24.52 
 
 		 627 aa  44.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 313 aa  44.3  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>