More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1512 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1480 aa  3039    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  57.38 
 
 
1468 aa  1640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 
916 aa  562  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1245 aa  509  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1303 aa  485  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.43 
 
 
1109 aa  475  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.72 
 
 
1653 aa  475  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  46.67 
 
 
1351 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1560 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
1118 aa  426  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1397 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
1040 aa  422  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  31.09 
 
 
2035 aa  416  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
812 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1363 aa  406  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1548 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.54 
 
 
1135 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
1326 aa  407  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1550 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1042 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1611 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1369 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.08 
 
 
1331 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
816 aa  399  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
1069 aa  399  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
1959 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
1398 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1240 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.59 
 
 
1763 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
929 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1165 aa  389  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
921 aa  390  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
705 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  41.37 
 
 
1346 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  41.36 
 
 
847 aa  387  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
1202 aa  387  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1310 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1767 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.13 
 
 
1765 aa  380  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
977 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.77 
 
 
2213 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
1767 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1771 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
835 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  35.92 
 
 
1021 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
1131 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.76 
 
 
1177 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.9 
 
 
923 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.21 
 
 
1499 aa  373  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.63 
 
 
1014 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  36.82 
 
 
861 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1765 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1767 aa  374  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
1267 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 
1626 aa  373  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  38.62 
 
 
931 aa  369  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
1625 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.83 
 
 
1442 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
833 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1126 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1284 aa  364  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.78 
 
 
1439 aa  363  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  37.28 
 
 
1001 aa  363  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1230 aa  363  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1333 aa  363  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1340 aa  363  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
801 aa  362  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
1266 aa  362  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1090 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
925 aa  362  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
1313 aa  362  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1629 aa  362  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
950 aa  361  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1622 aa  360  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1768 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
1582 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1629 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
946 aa  357  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1786 aa  357  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1784 aa  356  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1788 aa  356  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
1172 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1792 aa  355  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
1384 aa  353  8.999999999999999e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1782 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1072 aa  353  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  35.78 
 
 
727 aa  353  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1426 aa  352  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
1659 aa  351  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1245 aa  350  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
990 aa  350  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
1238 aa  350  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
770 aa  350  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1238 aa  350  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1234 aa  350  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1238 aa  348  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1009 aa  348  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
993 aa  348  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1238 aa  347  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  27.81 
 
 
1683 aa  347  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>