186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1501 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  393  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  46.45 
 
 
181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.2 
 
 
187 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  51.65 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  51.3 
 
 
161 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  47.74 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  45.41 
 
 
178 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  33.82 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  34.56 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  29.32 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  29.87 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  28.95 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.36 
 
 
699 aa  65.5  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
628 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.28 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  31.25 
 
 
581 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  29.2 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.56 
 
 
612 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  28.06 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.14 
 
 
493 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  25.64 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  28.06 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.55 
 
 
688 aa  61.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.47 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  28.79 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  27.39 
 
 
581 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  29.85 
 
 
591 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.13 
 
 
612 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.13 
 
 
612 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  30.47 
 
 
469 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  27.03 
 
 
622 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  35.17 
 
 
697 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  28.36 
 
 
589 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.77 
 
 
403 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  28.36 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  27.74 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  28.67 
 
 
644 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.45 
 
 
639 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.43 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  26.28 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.03 
 
 
634 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  26.87 
 
 
592 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  26.28 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.74 
 
 
626 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.91 
 
 
435 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 
487 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.17 
 
 
404 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  26.47 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  25.9 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  26.57 
 
 
691 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.66 
 
 
589 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.19 
 
 
598 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  29.41 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  27.97 
 
 
604 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 
174 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  24.41 
 
 
193 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  24.41 
 
 
193 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.17 
 
 
466 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  27.41 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1960  hypothetical protein  33.96 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  27.01 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  26.92 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  26.81 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.37 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  24.41 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  29.9 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.33 
 
 
596 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.1 
 
 
619 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.1 
 
 
619 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  29.9 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  27.07 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.07 
 
 
466 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  27.78 
 
 
498 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.1 
 
 
619 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.73 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  27.1 
 
 
369 aa  52.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  27.78 
 
 
153 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  26.95 
 
 
695 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  29.31 
 
 
437 aa  52  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
280 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.28 
 
 
623 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  25.62 
 
 
182 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.13 
 
 
641 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
213 aa  51.2  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.06 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.49 
 
 
589 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.96 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.8 
 
 
609 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.11 
 
 
576 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  26.28 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.59 
 
 
625 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.15 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.59 
 
 
622 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  23.36 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.9 
 
 
382 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  28.12 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  27.54 
 
 
422 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>