119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1434 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  63.03 
 
 		 761 aa  1012    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  70.75 
 
 		 757 aa  1110    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  65.56 
 
 		 756 aa  1024    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  76.79 
 
 		 754 aa  1216    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  49.93 
 
 		 864 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 753 aa  1531    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 786 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 793 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 866 aa  277  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 798 aa  267  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 798 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  29.91 
 
 		 798 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 798 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 798 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 798 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 798 aa  257  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 835 aa  251  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 798 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 882 aa  228  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 814 aa  224  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 836 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 812 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  25.3 
 
 		 959 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 798 aa  183  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 870 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 831 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 875 aa  134  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 838 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 879 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 815 aa  114  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 923 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 718 aa  62  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 728 aa  57.4  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 769 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 694 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 759 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  25.35 
 
 		 791 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 791 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 732 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 751 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 798 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 794 aa  51.2  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  24.08 
 
 		 804 aa  51.2  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  28.16 
 
 		 655 aa  50.8  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 742 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 627 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 783 aa  50.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 617 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  23.32 
 
 		 694 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 792 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  21.91 
 
 		 797 aa  48.9  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 737 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 943 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 751 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 749 aa  48.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 714 aa  48.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 708 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 711 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.56 
 
 		 718 aa  47.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  23.69 
 
 		 768 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.42 
 
 		 703 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2542  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 1048 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000765383  decreased coverage  0.00000552533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 780 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 723 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 738 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 764 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 730 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  31.97 
 
 		 763 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  31.97 
 
 		 720 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 731 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 768 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 703 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 719 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 743 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  25.52 
 
 		 697 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 734 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 767 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  23.39 
 
 		 730 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 779 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 931 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 764 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 820 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.79 
 
 		 1023 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.48 
 
 		 631 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  21.65 
 
 		 703 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 707 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 742 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 690 aa  45.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 817 aa  45.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  24.21 
 
 		 693 aa  45.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 792 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 616 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 649 aa  45.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 694 aa  45.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 821 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 763 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 763 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>