More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1431 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  82.82 
 
 		 227 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  81.5 
 
 		 227 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  78.57 
 
 		 238 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  75.89 
 
 		 237 aa  358  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  51.11 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  50 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.77 
 
 		 250 aa  221  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.11 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  52.68 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  50.67 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 214 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.43 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.98 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.82 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.64 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.89 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.08 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.35 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.54 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.54 
 
 		 239 aa  207  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  47.96 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.05 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.64 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  47.51 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.84 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.47 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  48.87 
 
 		 234 aa  204  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.06 
 
 		 253 aa  203  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.39 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.26 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  44.2 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  44.5 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.26 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 246 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.4 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  47.5 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  44.84 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.64 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  47.51 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.74 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  47.96 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.05 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  43.38 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  48.28 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  45.29 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  45.91 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.75 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.75 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.86 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  49.27 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.66 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  43.42 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.59 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  44.89 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.5 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.66 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.24 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.86 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.19 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.24 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.66 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.98 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>