245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1411 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 449 aa  886    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  64.65 
 
 		 448 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  63.22 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  57.88 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  56.24 
 
 		 448 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  53.6 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  50 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  47.27 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  49.44 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  48.74 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  50.56 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  49.44 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  46.5 
 
 		 454 aa  431  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  49.55 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  49.55 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  50.47 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  49.55 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  48.86 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  49.1 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  48.1 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  40.48 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  37.03 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.61 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.9 
 
 		 476 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.39 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.41 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  36.32 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  31.74 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.44 
 
 		 446 aa  222  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  37.26 
 
 		 453 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.39 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.3 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.98 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  35.64 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.03 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.32 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.03 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.42 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.32 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  34.3 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  31.37 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  31.37 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.81 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  35.73 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.85 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.47 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.06 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.86 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  31.57 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.34 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.99 
 
 		 461 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.98 
 
 		 447 aa  209  7e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  34.42 
 
 		 486 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.03 
 
 		 451 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  32.52 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.36 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  32.29 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  32.29 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.56 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 		 454 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.87 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  34.65 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.65 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.65 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.65 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.65 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.65 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.43 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  30.72 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.58 
 
 		 455 aa  199  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  37.38 
 
 		 448 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.48 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  33.7 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  31.49 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  32.24 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.93 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.4 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  32.98 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  34.65 
 
 		 445 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 478 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.22 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.35 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.99 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  32.68 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.41 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>