More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1366 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  94.11 
 
 		 1035 aa  1957    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  75.46 
 
 		 1033 aa  1584    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  38.46 
 
 		 1025 aa  675    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.51 
 
 		 1034 aa  916    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  76.14 
 
 		 1037 aa  1592    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  43.25 
 
 		 1041 aa  784    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.15 
 
 		 1024 aa  763    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  39.01 
 
 		 1029 aa  709    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  42.71 
 
 		 1048 aa  822    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.36 
 
 		 1029 aa  884    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.02 
 
 		 1031 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  83.04 
 
 		 1046 aa  1719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  48.55 
 
 		 1042 aa  952    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  37.84 
 
 		 1024 aa  671    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  84.76 
 
 		 1036 aa  1783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  47.45 
 
 		 1052 aa  853    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1064 aa  692    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  77.22 
 
 		 1037 aa  1626    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  43.25 
 
 		 1038 aa  770    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  39.84 
 
 		 1023 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  76.71 
 
 		 1036 aa  1604    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1035 aa  2087    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  46.86 
 
 		 1035 aa  932    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  83.82 
 
 		 1047 aa  1724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  45.16 
 
 		 1046 aa  843    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  42.88 
 
 		 1028 aa  800    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  46.7 
 
 		 1031 aa  919    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  48.45 
 
 		 1034 aa  946    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 		 1032 aa  641    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  42.1 
 
 		 1037 aa  786    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  46.6 
 
 		 1031 aa  917    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  46.6 
 
 		 1031 aa  918    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  83.82 
 
 		 1047 aa  1724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  46.5 
 
 		 1031 aa  916    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  83.92 
 
 		 1047 aa  1726    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  47.84 
 
 		 1038 aa  897    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  83.92 
 
 		 1047 aa  1729    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  46.42 
 
 		 1031 aa  907    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  47.67 
 
 		 1030 aa  940    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  38.27 
 
 		 1037 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1051 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  83.63 
 
 		 1046 aa  1731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  48.06 
 
 		 1031 aa  917    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  37.11 
 
 		 1037 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  45.24 
 
 		 1035 aa  857    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1048 aa  637    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  48.69 
 
 		 1031 aa  950    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  46.55 
 
 		 1036 aa  883    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  44.95 
 
 		 1041 aa  815    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  37.32 
 
 		 1026 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  36.82 
 
 		 1030 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  84.85 
 
 		 1042 aa  1742    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.5 
 
 		 1068 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  84.02 
 
 		 1051 aa  1731    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  46.7 
 
 		 1031 aa  926    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  83.82 
 
 		 1051 aa  1728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  46.7 
 
 		 1031 aa  926    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1036 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  80.27 
 
 		 1034 aa  1730    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  43.36 
 
 		 1040 aa  815    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  37.79 
 
 		 1036 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1037 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  39.61 
 
 		 1022 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  40.58 
 
 		 1045 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  84.02 
 
 		 1051 aa  1731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  46.7 
 
 		 1031 aa  926    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  36.44 
 
 		 1044 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1040 aa  622  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1040 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1051 aa  612  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1051 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  35 
 
 		 1019 aa  606  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  37.06 
 
 		 1029 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  33.99 
 
 		 1022 aa  602  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  34.9 
 
 		 1019 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1040 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1037 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  35.35 
 
 		 1017 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  35.32 
 
 		 1009 aa  598  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  35.2 
 
 		 1034 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  35.98 
 
 		 1018 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  35.98 
 
 		 1018 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  35.52 
 
 		 1043 aa  595  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  35.52 
 
 		 1043 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  35.7 
 
 		 1050 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  34.59 
 
 		 1032 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  33.8 
 
 		 1022 aa  592  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  35.9 
 
 		 1026 aa  591  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1028 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  36.34 
 
 		 1014 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  36.2 
 
 		 1014 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1049 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 1036 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  34.6 
 
 		 1044 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  36.2 
 
 		 1014 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  35.56 
 
 		 1033 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  36.58 
 
 		 1028 aa  581  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1028 aa  579  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  35.83 
 
 		 1048 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  35.71 
 
 		 1014 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>