More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1344 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  51.06 
 
 		 189 aa  201  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  44.86 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  45.56 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  45.56 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  45.56 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  45.56 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  45.09 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 191 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  38.34 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.1 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  38.33 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  34.16 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  30.62 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.35 
 
 		 294 aa  98.6  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 440 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 449 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.82 
 
 		 447 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.16 
 
 		 319 aa  95.5  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.06 
 
 		 417 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 401 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.29 
 
 		 420 aa  91.3  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.15 
 
 		 350 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.15 
 
 		 350 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.37 
 
 		 427 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  35.44 
 
 		 445 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  32.7 
 
 		 445 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.52 
 
 		 333 aa  88.2  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.11 
 
 		 337 aa  88.2  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.9 
 
 		 429 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.76 
 
 		 344 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 375 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.15 
 
 		 344 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.15 
 
 		 344 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.15 
 
 		 344 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.22 
 
 		 337 aa  85.1  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.54 
 
 		 344 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 244 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.42 
 
 		 240 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  32.93 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.93 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.52 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.22 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.54 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  45.16 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  34.94 
 
 		 388 aa  82  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  82  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.93 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.14 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.58 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  38.33 
 
 		 542 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  33.74 
 
 		 510 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  34.06 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 380 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 403 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  31.33 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  30.86 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.75 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  37.5 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  37.5 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  32.7 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  32.16 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  32.91 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.91 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  32.93 
 
 		 375 aa  74.7  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 352 aa  74.7  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  32.93 
 
 		 375 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  32.91 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.7 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.16 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.53 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  37.5 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.2 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.44 
 
 		 478 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 468 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.6 
 
 		 270 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.53 
 
 		 243 aa  72  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  32.21 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 466 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  37.86 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 543 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.32 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>