134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1312 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  100 
 
 
300 aa  610  1e-174  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.03615e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1212  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  84.07 
 
 
298 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000148671  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  76.01 
 
 
299 aa  459  1e-128  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  75.6 
 
 
302 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  73.22 
 
 
298 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  75.26 
 
 
300 aa  444  1e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  75.26 
 
 
311 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.4561e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  75.95 
 
 
318 aa  445  1e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  74.92 
 
 
302 aa  447  1e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  75.26 
 
 
311 aa  446  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.18856e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  74.91 
 
 
311 aa  444  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.00246e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  74.58 
 
 
302 aa  447  1e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.22964e-08  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  74.91 
 
 
311 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.62311e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  69.83 
 
 
299 aa  416  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  69.39 
 
 
301 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  47.08 
 
 
303 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  3.5288e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  47.62 
 
 
297 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0298  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.93 
 
 
327 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.27 
 
 
299 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00859  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.25 
 
 
304 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.1 
 
 
289 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0709  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.04 
 
 
297 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.74 
 
 
293 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3677  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 
302 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3528  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.74 
 
 
304 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.69 
 
 
303 aa  147  2e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03429  hypothetical protein  35.63 
 
 
296 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002580  glucosamine kinase GpsK  34.1 
 
 
296 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2582  glucosamine kinase  32.33 
 
 
291 aa  142  1e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  32.14 
 
 
294 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.98 
 
 
294 aa  134  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  35.23 
 
 
288 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  35.23 
 
 
288 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.92 
 
 
294 aa  125  8e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 
295 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.1 
 
 
286 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  31.94 
 
 
295 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  31.94 
 
 
295 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
293 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.88 
 
 
294 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.2 
 
 
308 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.42 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.32837e-06 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.72 
 
 
293 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.77 
 
 
293 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.47 
 
 
298 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  33.2 
 
 
311 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  33.2 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  33.2 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  33.2 
 
 
311 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  31.5 
 
 
296 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  33.2 
 
 
311 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  33.2 
 
 
311 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  33.2 
 
 
311 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.2 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2598  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.95 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.92 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.05 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.6 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.6 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.74 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.22 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  30 
 
 
293 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.2 
 
 
293 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.22 
 
 
326 aa  85.5  1e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.84 
 
 
316 aa  81.3  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.95 
 
 
296 aa  80.1  4e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.12 
 
 
322 aa  79.7  5e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.03 
 
 
319 aa  76.6  4e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.69 
 
 
307 aa  75.9  8e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.6 
 
 
300 aa  73.9  3e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.47 
 
 
322 aa  73.6  4e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  27.98 
 
 
301 aa  73.6  4e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.90255e-05  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  30.71 
 
 
369 aa  73.6  4e-12  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  24.36 
 
 
299 aa  73.2  5e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  3.91885e-07 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.49 
 
 
313 aa  72.4  9e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28 
 
 
299 aa  70.9  2e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.52 
 
 
305 aa  70.9  3e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.76 
 
 
295 aa  67  4e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  27.42 
 
 
318 aa  65.9  9e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.43 
 
 
320 aa  65.5  1e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.13 
 
 
295 aa  65.5  1e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  1.02812e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.17 
 
 
308 aa  63.9  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4023  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30 
 
 
382 aa  62  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  23.36 
 
 
299 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.86 
 
 
324 aa  62  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.87 
 
 
328 aa  62  1e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.37 
 
 
325 aa  61.6  2e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  28.02 
 
 
307 aa  61.2  2e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.79 
 
 
299 aa  61.2  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.82 
 
 
348 aa  61.6  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.09 
 
 
300 aa  60.5  3e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.7 
 
 
298 aa  60.5  3e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.84 
 
 
314 aa  60.5  4e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.88 
 
 
338 aa  60.5  4e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  23.36 
 
 
299 aa  59.3  7e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  24.21 
 
 
299 aa  58.5  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.12 
 
 
301 aa  57.8  2e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3614  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.13 
 
 
334 aa  58.2  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480053  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.87 
 
 
299 aa  58.2  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24411  N-acetylglucosamine kinase  32.8 
 
 
320 aa  58.2  2e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>