284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1247 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
132 aa  264  3e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.9749e-06  unclonable  1.06801e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  82.58 
 
 
132 aa  195  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  82.58 
 
 
133 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  76.52 
 
 
131 aa  180  5e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.47 
 
 
125 aa  154  5e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  70.23 
 
 
126 aa  150  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  69.47 
 
 
127 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.41 
 
 
126 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 
127 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 
127 aa  139  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.96 
 
 
126 aa  139  2e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.18 
 
 
127 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 
127 aa  137  5e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.41 
 
 
127 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 
127 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.18 
 
 
127 aa  135  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.18 
 
 
127 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.67 
 
 
126 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.2 
 
 
126 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  52.67 
 
 
126 aa  130  8e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.91 
 
 
126 aa  129  1e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  128  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 
126 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
126 aa  127  4e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.2 
 
 
126 aa  127  5e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
126 aa  126  8e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 
126 aa  126  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
126 aa  126  1e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
126 aa  126  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.54 
 
 
126 aa  125  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
126 aa  125  2e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 
126 aa  125  2e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.62 
 
 
126 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 
126 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.85 
 
 
126 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.46 
 
 
126 aa  120  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.09 
 
 
126 aa  119  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.09 
 
 
126 aa  119  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.33 
 
 
126 aa  118  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.36 
 
 
119 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.04 
 
 
125 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.11 
 
 
130 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.56 
 
 
123 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  44.7 
 
 
127 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.93 
 
 
127 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.12 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.42 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.23 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.97 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.38 
 
 
158 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
150 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.3 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.61 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.01 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.61 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.91 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.97 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.22 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  41.22 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.86 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
134 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 
134 aa  87  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.71 
 
 
132 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.07 
 
 
119 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.86 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.08 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.44 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.88 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.3 
 
 
119 aa  84.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.64 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.71 
 
 
139 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
132 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.97 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.3 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  83.2  1e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  83.2  1e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  83.2  1e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  83.2  1e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.08 
 
 
126 aa  83.2  1e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
142 aa  83.2  1e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.04 
 
 
119 aa  83.2  1e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.86 
 
 
131 aa  82.8  1e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.32324e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
123 aa  83.2  1e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>