124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1245 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1245  DNA repair protein RecO  100 
 
 
228 aa  470  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.28511e-05  unclonable  1.23287e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1150  DNA repair protein RecO  85.65 
 
 
226 aa  404  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1056  DNA repair protein RecO  71.43 
 
 
231 aa  335  4e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1039  DNA repair protein RecO  57.46 
 
 
229 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3110  DNA repair protein RecO  58.08 
 
 
236 aa  265  3e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0026851  normal  0.0227356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1280  DNA repair protein RecO  57.64 
 
 
236 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.588723  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1203  DNA repair protein RecO  58.08 
 
 
236 aa  265  6e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0374149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1247  DNA repair protein RecO  57.64 
 
 
236 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00802629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1161  DNA repair protein RecO  56.33 
 
 
236 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2928  DNA repair protein RecO  56.11 
 
 
233 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2846  DNA repair protein RecO  55.66 
 
 
233 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.403823  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3024  DNA repair protein RecO  56.11 
 
 
233 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1350  DNA repair protein RecO  56.11 
 
 
233 aa  255  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2927  DNA repair protein RecO  52.12 
 
 
240 aa  244  5e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0882  DNA repair protein RecO  51.54 
 
 
224 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2764  DNA repair protein RecO  50.21 
 
 
240 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 
240 aa  139  4e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03405  DNA repair protein RecO  37.07 
 
 
234 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  39.01 
 
 
233 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  34.38 
 
 
241 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  34.38 
 
 
241 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  34.38 
 
 
241 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  34.38 
 
 
244 aa  131  7e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 
242 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  37.61 
 
 
233 aa  131  1e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  36.61 
 
 
234 aa  131  1e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  37.22 
 
 
231 aa  131  1e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 
242 aa  130  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 
242 aa  130  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 
242 aa  130  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  33.04 
 
 
242 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  33.04 
 
 
242 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  40 
 
 
229 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  33.04 
 
 
242 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  33.04 
 
 
242 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  32.59 
 
 
242 aa  129  4e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  32.59 
 
 
242 aa  129  4e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  32.59 
 
 
242 aa  129  4e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  32.59 
 
 
242 aa  129  4e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  32.59 
 
 
242 aa  129  4e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 
236 aa  129  5e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  33.04 
 
 
242 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
243 aa  127  2e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  33.04 
 
 
244 aa  125  4e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  37.44 
 
 
229 aa  125  4e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1075  DNA repair protein RecO  40.27 
 
 
227 aa  124  8e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
245 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13820  DNA repair protein RecO  37 
 
 
230 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  34.82 
 
 
278 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
245 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
279 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
279 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1435  DNA repair protein RecO  38.29 
 
 
227 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4286  DNA repair protein RecO  38.46 
 
 
227 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
278 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
278 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
278 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
275 aa  119  4e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
275 aa  119  4e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
286 aa  119  4e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
275 aa  119  4e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
275 aa  119  5e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
278 aa  119  5e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
286 aa  119  5e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  33.93 
 
 
275 aa  119  5e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 
286 aa  117  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1386  DNA repair protein RecO  34.47 
 
 
241 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  30.7 
 
 
238 aa  115  4e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4215  DNA repair protein RecO  37.44 
 
 
227 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.322545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3949  DNA repair protein RecO  37.9 
 
 
227 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  33.18 
 
 
241 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  35.27 
 
 
242 aa  115  7e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  32.59 
 
 
336 aa  114  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  32.74 
 
 
233 aa  114  1e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  33.62 
 
 
246 aa  113  2e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  33.64 
 
 
234 aa  113  2e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4372  DNA repair protein RecO  38.01 
 
 
227 aa  112  4e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.197267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  33.63 
 
 
235 aa  111  8e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 
273 aa  110  2e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 
273 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  31.84 
 
 
272 aa  109  4e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  30.63 
 
 
243 aa  108  8e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1010  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 
244 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0866  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 
244 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0186156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 
309 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  32.3 
 
 
242 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  30.8 
 
 
306 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  32.17 
 
 
242 aa  104  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
256 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  35.81 
 
 
246 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  31.06 
 
 
252 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1349  DNA repair protein RecO  31.53 
 
 
247 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0093  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
202 aa  96.3  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  30.94 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  29.78 
 
 
291 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  29.26 
 
 
244 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4120  recombination protein O  27.73 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  29.13 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>