More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1242 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  100 
 
 
305 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.42839e-08  unclonable  1.49917e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  90.82 
 
 
305 aa  577  1e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.85511e-06  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  80.98 
 
 
305 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  79.28 
 
 
305 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  73.36 
 
 
305 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.21734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  73.03 
 
 
305 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  70.72 
 
 
305 aa  465  1e-130  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  69.41 
 
 
304 aa  451  1e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  68.2 
 
 
305 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  68.75 
 
 
304 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.72836e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  63.61 
 
 
304 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  64.71 
 
 
300 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  60.53 
 
 
301 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  3.79573e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  60.59 
 
 
299 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  61.56 
 
 
299 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  60.13 
 
 
298 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  59.09 
 
 
300 aa  359  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  54.37 
 
 
310 aa  349  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  56.39 
 
 
301 aa  329  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  47.49 
 
 
332 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  47.2 
 
 
332 aa  315  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  47.49 
 
 
332 aa  315  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  47.29 
 
 
325 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  47.42 
 
 
322 aa  308  1e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  306  2e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  306  2e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  306  2e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  49.55 
 
 
324 aa  306  2e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  306  2e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  49.85 
 
 
324 aa  306  2e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  49.55 
 
 
324 aa  306  4e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  49.55 
 
 
324 aa  306  4e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  303  2e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  48.04 
 
 
324 aa  303  2e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  47.11 
 
 
322 aa  303  2e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  303  2e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  303  2e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  49.85 
 
 
324 aa  303  2e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  47.11 
 
 
321 aa  303  3e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  47.11 
 
 
321 aa  302  4e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  48.36 
 
 
263 aa  252  5e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  48.08 
 
 
267 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  48.06 
 
 
262 aa  243  2e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  46.81 
 
 
266 aa  242  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  47.46 
 
 
267 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  41.46 
 
 
343 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  45.7 
 
 
270 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  48 
 
 
248 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  48 
 
 
248 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  45.31 
 
 
283 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44.29 
 
 
274 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  40.36 
 
 
311 aa  229  3e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  44.22 
 
 
305 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  42.76 
 
 
325 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  43.19 
 
 
255 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.86529e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  42.95 
 
 
297 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  43.81 
 
 
299 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  43.79 
 
 
269 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  45.14 
 
 
256 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  42.95 
 
 
297 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  43.25 
 
 
284 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  41.18 
 
 
322 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  43.25 
 
 
284 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  43.81 
 
 
284 aa  221  1e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  40.33 
 
 
325 aa  220  2e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  44.44 
 
 
262 aa  219  4e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  45.61 
 
 
268 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  42.81 
 
 
299 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  41.69 
 
 
284 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  43.77 
 
 
268 aa  216  3e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  44.67 
 
 
284 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  40.2 
 
 
325 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  41.37 
 
 
284 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  43.64 
 
 
284 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  43.64 
 
 
284 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  43.25 
 
 
284 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  42.54 
 
 
284 aa  213  3e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  38.8 
 
 
321 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  39.53 
 
 
322 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.67 
 
 
251 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  40.94 
 
 
251 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  39.53 
 
 
322 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  40.6 
 
 
297 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  39.6 
 
 
297 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  40.86 
 
 
266 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  40.27 
 
 
297 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  39.86 
 
 
321 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  40.27 
 
 
297 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  39.67 
 
 
322 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24318e-05 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  41.75 
 
 
324 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  40.27 
 
 
297 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  40.4 
 
 
297 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  40.4 
 
 
297 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>